Protein–RNA interactions for Protein: Q9D572

Ubxn11, UBX domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn11Q9D572 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ubxn11Q9D572 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ubxn11Q9D572 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ubxn11Q9D572 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ubxn11Q9D572 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ubxn11Q9D572 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ubxn11Q9D572 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ubxn11Q9D572 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ubxn11Q9D572 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ubxn11Q9D572 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ubxn11Q9D572 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ubxn11Q9D572 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ubxn11Q9D572 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Ubxn11Q9D572 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ubxn11Q9D572 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ubxn11Q9D572 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ubxn11Q9D572 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ubxn11Q9D572 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ubxn11Q9D572 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ubxn11Q9D572 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ubxn11Q9D572 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ubxn11Q9D572 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Ubxn11Q9D572 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Ubxn11Q9D572 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ubxn11Q9D572 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ubxn11Q9D572 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Ubxn11Q9D572 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ubxn11Q9D572 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ubxn11Q9D572 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ubxn11Q9D572 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ubxn11Q9D572 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ubxn11Q9D572 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ubxn11Q9D572 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Ubxn11Q9D572 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ubxn11Q9D572 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ubxn11Q9D572 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ubxn11Q9D572 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ubxn11Q9D572 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ubxn11Q9D572 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ubxn11Q9D572 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ubxn11Q9D572 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ubxn11Q9D572 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ubxn11Q9D572 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ubxn11Q9D572 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Ubxn11Q9D572 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Ubxn11Q9D572 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ubxn11Q9D572 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ubxn11Q9D572 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ubxn11Q9D572 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ubxn11Q9D572 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ubxn11Q9D572 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ubxn11Q9D572 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ubxn11Q9D572 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Ubxn11Q9D572 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ubxn11Q9D572 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ubxn11Q9D572 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ubxn11Q9D572 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ubxn11Q9D572 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ubxn11Q9D572 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ubxn11Q9D572 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ubxn11Q9D572 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ubxn11Q9D572 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ubxn11Q9D572 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ubxn11Q9D572 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Ubxn11Q9D572 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Ubxn11Q9D572 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ubxn11Q9D572 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ubxn11Q9D572 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ubxn11Q9D572 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ubxn11Q9D572 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ubxn11Q9D572 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ubxn11Q9D572 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Ubxn11Q9D572 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ubxn11Q9D572 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ubxn11Q9D572 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ubxn11Q9D572 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ubxn11Q9D572 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ubxn11Q9D572 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ubxn11Q9D572 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Ubxn11Q9D572 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Ubxn11Q9D572 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Ubxn11Q9D572 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Ubxn11Q9D572 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ubxn11Q9D572 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ubxn11Q9D572 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ubxn11Q9D572 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ubxn11Q9D572 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ubxn11Q9D572 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ubxn11Q9D572 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ubxn11Q9D572 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ubxn11Q9D572 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ubxn11Q9D572 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ubxn11Q9D572 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ubxn11Q9D572 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ubxn11Q9D572 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ubxn11Q9D572 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ubxn11Q9D572 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ubxn11Q9D572 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ubxn11Q9D572 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ubxn11Q9D572 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms