Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3X3

4933428M09Rik, RIKEN cDNA 4933428M09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933428M09RikQ9D3X3 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
4933428M09RikQ9D3X3 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
4933428M09RikQ9D3X3 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
4933428M09RikQ9D3X3 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
4933428M09RikQ9D3X3 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
4933428M09RikQ9D3X3 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
4933428M09RikQ9D3X3 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
4933428M09RikQ9D3X3 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
4933428M09RikQ9D3X3 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
4933428M09RikQ9D3X3 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
4933428M09RikQ9D3X3 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
4933428M09RikQ9D3X3 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
4933428M09RikQ9D3X3 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
4933428M09RikQ9D3X3 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
4933428M09RikQ9D3X3 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
4933428M09RikQ9D3X3 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
4933428M09RikQ9D3X3 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
4933428M09RikQ9D3X3 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
4933428M09RikQ9D3X3 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
4933428M09RikQ9D3X3 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
4933428M09RikQ9D3X3 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
4933428M09RikQ9D3X3 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
4933428M09RikQ9D3X3 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
4933428M09RikQ9D3X3 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
4933428M09RikQ9D3X3 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
4933428M09RikQ9D3X3 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
4933428M09RikQ9D3X3 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
4933428M09RikQ9D3X3 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
4933428M09RikQ9D3X3 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
4933428M09RikQ9D3X3 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
4933428M09RikQ9D3X3 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
4933428M09RikQ9D3X3 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
4933428M09RikQ9D3X3 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
4933428M09RikQ9D3X3 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
4933428M09RikQ9D3X3 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
4933428M09RikQ9D3X3 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
4933428M09RikQ9D3X3 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
4933428M09RikQ9D3X3 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
4933428M09RikQ9D3X3 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
4933428M09RikQ9D3X3 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
4933428M09RikQ9D3X3 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
4933428M09RikQ9D3X3 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
4933428M09RikQ9D3X3 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
4933428M09RikQ9D3X3 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
4933428M09RikQ9D3X3 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
4933428M09RikQ9D3X3 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
4933428M09RikQ9D3X3 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
4933428M09RikQ9D3X3 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
4933428M09RikQ9D3X3 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
4933428M09RikQ9D3X3 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
4933428M09RikQ9D3X3 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
4933428M09RikQ9D3X3 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
4933428M09RikQ9D3X3 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
4933428M09RikQ9D3X3 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
4933428M09RikQ9D3X3 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
4933428M09RikQ9D3X3 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
4933428M09RikQ9D3X3 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
4933428M09RikQ9D3X3 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
4933428M09RikQ9D3X3 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
4933428M09RikQ9D3X3 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
4933428M09RikQ9D3X3 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
4933428M09RikQ9D3X3 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
4933428M09RikQ9D3X3 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
4933428M09RikQ9D3X3 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
4933428M09RikQ9D3X3 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
4933428M09RikQ9D3X3 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
4933428M09RikQ9D3X3 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
4933428M09RikQ9D3X3 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
4933428M09RikQ9D3X3 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
4933428M09RikQ9D3X3 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
4933428M09RikQ9D3X3 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
4933428M09RikQ9D3X3 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
4933428M09RikQ9D3X3 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
4933428M09RikQ9D3X3 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
4933428M09RikQ9D3X3 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
4933428M09RikQ9D3X3 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
4933428M09RikQ9D3X3 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
4933428M09RikQ9D3X3 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
4933428M09RikQ9D3X3 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
4933428M09RikQ9D3X3 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
4933428M09RikQ9D3X3 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
4933428M09RikQ9D3X3 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
4933428M09RikQ9D3X3 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
4933428M09RikQ9D3X3 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
4933428M09RikQ9D3X3 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
4933428M09RikQ9D3X3 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
4933428M09RikQ9D3X3 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
4933428M09RikQ9D3X3 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
4933428M09RikQ9D3X3 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
4933428M09RikQ9D3X3 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
4933428M09RikQ9D3X3 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
4933428M09RikQ9D3X3 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
4933428M09RikQ9D3X3 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
4933428M09RikQ9D3X3 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
4933428M09RikQ9D3X3 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
4933428M09RikQ9D3X3 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
4933428M09RikQ9D3X3 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
4933428M09RikQ9D3X3 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
4933428M09RikQ9D3X3 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
4933428M09RikQ9D3X3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms