Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trappc6bQ9D289 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trappc6bQ9D289 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trappc6bQ9D289 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trappc6bQ9D289 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trappc6bQ9D289 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trappc6bQ9D289 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trappc6bQ9D289 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Trappc6bQ9D289 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Trappc6bQ9D289 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trappc6bQ9D289 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trappc6bQ9D289 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trappc6bQ9D289 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trappc6bQ9D289 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trappc6bQ9D289 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trappc6bQ9D289 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trappc6bQ9D289 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trappc6bQ9D289 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trappc6bQ9D289 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trappc6bQ9D289 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trappc6bQ9D289 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trappc6bQ9D289 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trappc6bQ9D289 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trappc6bQ9D289 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trappc6bQ9D289 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trappc6bQ9D289 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trappc6bQ9D289 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trappc6bQ9D289 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trappc6bQ9D289 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trappc6bQ9D289 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trappc6bQ9D289 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Trappc6bQ9D289 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trappc6bQ9D289 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trappc6bQ9D289 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trappc6bQ9D289 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trappc6bQ9D289 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trappc6bQ9D289 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trappc6bQ9D289 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trappc6bQ9D289 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trappc6bQ9D289 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trappc6bQ9D289 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trappc6bQ9D289 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trappc6bQ9D289 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trappc6bQ9D289 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trappc6bQ9D289 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trappc6bQ9D289 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trappc6bQ9D289 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trappc6bQ9D289 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trappc6bQ9D289 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trappc6bQ9D289 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trappc6bQ9D289 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trappc6bQ9D289 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trappc6bQ9D289 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trappc6bQ9D289 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trappc6bQ9D289 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trappc6bQ9D289 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trappc6bQ9D289 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trappc6bQ9D289 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Trappc6bQ9D289 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trappc6bQ9D289 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trappc6bQ9D289 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trappc6bQ9D289 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trappc6bQ9D289 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trappc6bQ9D289 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trappc6bQ9D289 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trappc6bQ9D289 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trappc6bQ9D289 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trappc6bQ9D289 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trappc6bQ9D289 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trappc6bQ9D289 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trappc6bQ9D289 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trappc6bQ9D289 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trappc6bQ9D289 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trappc6bQ9D289 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trappc6bQ9D289 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trappc6bQ9D289 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trappc6bQ9D289 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trappc6bQ9D289 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trappc6bQ9D289 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trappc6bQ9D289 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trappc6bQ9D289 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trappc6bQ9D289 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trappc6bQ9D289 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trappc6bQ9D289 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trappc6bQ9D289 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trappc6bQ9D289 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trappc6bQ9D289 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trappc6bQ9D289 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trappc6bQ9D289 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Trappc6bQ9D289 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trappc6bQ9D289 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trappc6bQ9D289 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trappc6bQ9D289 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trappc6bQ9D289 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trappc6bQ9D289 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trappc6bQ9D289 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trappc6bQ9D289 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trappc6bQ9D289 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trappc6bQ9D289 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trappc6bQ9D289 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms