Protein–RNA interactions for Protein: Q9D275

Batf3, Basic leucine zipper transcriptional factor ATF-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Batf3Q9D275 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Batf3Q9D275 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Batf3Q9D275 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Batf3Q9D275 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Batf3Q9D275 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Batf3Q9D275 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Batf3Q9D275 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Batf3Q9D275 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Batf3Q9D275 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Batf3Q9D275 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Batf3Q9D275 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Batf3Q9D275 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Batf3Q9D275 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Batf3Q9D275 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Batf3Q9D275 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Batf3Q9D275 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Batf3Q9D275 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Batf3Q9D275 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Batf3Q9D275 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Batf3Q9D275 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Batf3Q9D275 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Batf3Q9D275 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Batf3Q9D275 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Batf3Q9D275 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Batf3Q9D275 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Batf3Q9D275 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Batf3Q9D275 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Batf3Q9D275 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Batf3Q9D275 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Batf3Q9D275 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Batf3Q9D275 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Batf3Q9D275 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Batf3Q9D275 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Batf3Q9D275 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Batf3Q9D275 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Batf3Q9D275 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Batf3Q9D275 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Batf3Q9D275 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Batf3Q9D275 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Batf3Q9D275 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Batf3Q9D275 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Batf3Q9D275 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Batf3Q9D275 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Batf3Q9D275 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Batf3Q9D275 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Batf3Q9D275 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Batf3Q9D275 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Batf3Q9D275 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Batf3Q9D275 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Batf3Q9D275 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Batf3Q9D275 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Batf3Q9D275 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Batf3Q9D275 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Batf3Q9D275 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Batf3Q9D275 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Batf3Q9D275 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Batf3Q9D275 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Batf3Q9D275 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Batf3Q9D275 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Batf3Q9D275 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Batf3Q9D275 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Batf3Q9D275 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Batf3Q9D275 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Batf3Q9D275 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Batf3Q9D275 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Batf3Q9D275 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Batf3Q9D275 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Batf3Q9D275 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Batf3Q9D275 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Batf3Q9D275 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Batf3Q9D275 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Batf3Q9D275 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Batf3Q9D275 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Batf3Q9D275 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Batf3Q9D275 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Batf3Q9D275 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Batf3Q9D275 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Batf3Q9D275 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Batf3Q9D275 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Batf3Q9D275 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Batf3Q9D275 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Batf3Q9D275 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Batf3Q9D275 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Batf3Q9D275 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Batf3Q9D275 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Batf3Q9D275 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Batf3Q9D275 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Batf3Q9D275 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Batf3Q9D275 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Batf3Q9D275 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Batf3Q9D275 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Batf3Q9D275 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Batf3Q9D275 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Batf3Q9D275 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Batf3Q9D275 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Batf3Q9D275 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Batf3Q9D275 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Batf3Q9D275 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Batf3Q9D275 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Batf3Q9D275 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms