Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1Z3

Fam173b, Protein FAM173B, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam173bQ9D1Z3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fam173bQ9D1Z3 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fam173bQ9D1Z3 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fam173bQ9D1Z3 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fam173bQ9D1Z3 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fam173bQ9D1Z3 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fam173bQ9D1Z3 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fam173bQ9D1Z3 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fam173bQ9D1Z3 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fam173bQ9D1Z3 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fam173bQ9D1Z3 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Fam173bQ9D1Z3 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fam173bQ9D1Z3 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fam173bQ9D1Z3 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Fam173bQ9D1Z3 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fam173bQ9D1Z3 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fam173bQ9D1Z3 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fam173bQ9D1Z3 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fam173bQ9D1Z3 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fam173bQ9D1Z3 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fam173bQ9D1Z3 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Fam173bQ9D1Z3 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fam173bQ9D1Z3 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fam173bQ9D1Z3 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fam173bQ9D1Z3 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fam173bQ9D1Z3 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fam173bQ9D1Z3 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fam173bQ9D1Z3 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fam173bQ9D1Z3 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fam173bQ9D1Z3 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fam173bQ9D1Z3 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam173bQ9D1Z3 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam173bQ9D1Z3 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam173bQ9D1Z3 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam173bQ9D1Z3 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam173bQ9D1Z3 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam173bQ9D1Z3 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam173bQ9D1Z3 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam173bQ9D1Z3 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam173bQ9D1Z3 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam173bQ9D1Z3 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam173bQ9D1Z3 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam173bQ9D1Z3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fam173bQ9D1Z3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fam173bQ9D1Z3 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fam173bQ9D1Z3 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fam173bQ9D1Z3 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fam173bQ9D1Z3 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fam173bQ9D1Z3 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fam173bQ9D1Z3 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fam173bQ9D1Z3 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fam173bQ9D1Z3 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fam173bQ9D1Z3 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fam173bQ9D1Z3 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fam173bQ9D1Z3 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fam173bQ9D1Z3 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Fam173bQ9D1Z3 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fam173bQ9D1Z3 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fam173bQ9D1Z3 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fam173bQ9D1Z3 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fam173bQ9D1Z3 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fam173bQ9D1Z3 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fam173bQ9D1Z3 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fam173bQ9D1Z3 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fam173bQ9D1Z3 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fam173bQ9D1Z3 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fam173bQ9D1Z3 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fam173bQ9D1Z3 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fam173bQ9D1Z3 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fam173bQ9D1Z3 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fam173bQ9D1Z3 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fam173bQ9D1Z3 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fam173bQ9D1Z3 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fam173bQ9D1Z3 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Fam173bQ9D1Z3 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Fam173bQ9D1Z3 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Fam173bQ9D1Z3 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Fam173bQ9D1Z3 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Fam173bQ9D1Z3 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fam173bQ9D1Z3 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Fam173bQ9D1Z3 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fam173bQ9D1Z3 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Fam173bQ9D1Z3 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fam173bQ9D1Z3 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Fam173bQ9D1Z3 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Fam173bQ9D1Z3 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fam173bQ9D1Z3 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Fam173bQ9D1Z3 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fam173bQ9D1Z3 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fam173bQ9D1Z3 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Fam173bQ9D1Z3 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Fam173bQ9D1Z3 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fam173bQ9D1Z3 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fam173bQ9D1Z3 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fam173bQ9D1Z3 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fam173bQ9D1Z3 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fam173bQ9D1Z3 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fam173bQ9D1Z3 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fam173bQ9D1Z3 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Fam173bQ9D1Z3 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 213.9 ms