Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0B8

Ribc1, RIB43A-like with coiled-coils protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ribc1Q9D0B8 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ribc1Q9D0B8 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ribc1Q9D0B8 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ribc1Q9D0B8 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Ribc1Q9D0B8 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ribc1Q9D0B8 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ribc1Q9D0B8 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ribc1Q9D0B8 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ribc1Q9D0B8 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Ribc1Q9D0B8 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ribc1Q9D0B8 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ribc1Q9D0B8 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ribc1Q9D0B8 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ribc1Q9D0B8 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ribc1Q9D0B8 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ribc1Q9D0B8 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ribc1Q9D0B8 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ribc1Q9D0B8 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ribc1Q9D0B8 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ribc1Q9D0B8 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ribc1Q9D0B8 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ribc1Q9D0B8 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ribc1Q9D0B8 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ribc1Q9D0B8 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ribc1Q9D0B8 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ribc1Q9D0B8 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ribc1Q9D0B8 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ribc1Q9D0B8 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ribc1Q9D0B8 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ribc1Q9D0B8 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ribc1Q9D0B8 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ribc1Q9D0B8 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ribc1Q9D0B8 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ribc1Q9D0B8 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ribc1Q9D0B8 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ribc1Q9D0B8 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ribc1Q9D0B8 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ribc1Q9D0B8 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ribc1Q9D0B8 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Ribc1Q9D0B8 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Ribc1Q9D0B8 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ribc1Q9D0B8 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ribc1Q9D0B8 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ribc1Q9D0B8 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ribc1Q9D0B8 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ribc1Q9D0B8 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ribc1Q9D0B8 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ribc1Q9D0B8 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ribc1Q9D0B8 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ribc1Q9D0B8 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ribc1Q9D0B8 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ribc1Q9D0B8 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ribc1Q9D0B8 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ribc1Q9D0B8 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ribc1Q9D0B8 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ribc1Q9D0B8 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ribc1Q9D0B8 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ribc1Q9D0B8 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ribc1Q9D0B8 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ribc1Q9D0B8 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ribc1Q9D0B8 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ribc1Q9D0B8 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ribc1Q9D0B8 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ribc1Q9D0B8 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ribc1Q9D0B8 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ribc1Q9D0B8 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ribc1Q9D0B8 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ribc1Q9D0B8 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ribc1Q9D0B8 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ribc1Q9D0B8 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ribc1Q9D0B8 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ribc1Q9D0B8 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ribc1Q9D0B8 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ribc1Q9D0B8 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ribc1Q9D0B8 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ribc1Q9D0B8 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ribc1Q9D0B8 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ribc1Q9D0B8 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ribc1Q9D0B8 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ribc1Q9D0B8 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ribc1Q9D0B8 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ribc1Q9D0B8 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ribc1Q9D0B8 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ribc1Q9D0B8 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ribc1Q9D0B8 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ribc1Q9D0B8 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ribc1Q9D0B8 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ribc1Q9D0B8 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ribc1Q9D0B8 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ribc1Q9D0B8 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ribc1Q9D0B8 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ribc1Q9D0B8 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ribc1Q9D0B8 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ribc1Q9D0B8 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ribc1Q9D0B8 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ribc1Q9D0B8 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Ribc1Q9D0B8 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ribc1Q9D0B8 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ribc1Q9D0B8 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ribc1Q9D0B8 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms