Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZW4

Acsl3, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acsl3Q9CZW4 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Acsl3Q9CZW4 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Acsl3Q9CZW4 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Acsl3Q9CZW4 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Acsl3Q9CZW4 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Acsl3Q9CZW4 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Acsl3Q9CZW4 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Acsl3Q9CZW4 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Acsl3Q9CZW4 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Acsl3Q9CZW4 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Acsl3Q9CZW4 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Acsl3Q9CZW4 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Acsl3Q9CZW4 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Acsl3Q9CZW4 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Acsl3Q9CZW4 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Acsl3Q9CZW4 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Acsl3Q9CZW4 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Acsl3Q9CZW4 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Acsl3Q9CZW4 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Acsl3Q9CZW4 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Acsl3Q9CZW4 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Acsl3Q9CZW4 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Acsl3Q9CZW4 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Acsl3Q9CZW4 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Acsl3Q9CZW4 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Acsl3Q9CZW4 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Acsl3Q9CZW4 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Acsl3Q9CZW4 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Acsl3Q9CZW4 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Acsl3Q9CZW4 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Acsl3Q9CZW4 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Acsl3Q9CZW4 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Acsl3Q9CZW4 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Acsl3Q9CZW4 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Acsl3Q9CZW4 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Acsl3Q9CZW4 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Acsl3Q9CZW4 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Acsl3Q9CZW4 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Acsl3Q9CZW4 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Acsl3Q9CZW4 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Acsl3Q9CZW4 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Acsl3Q9CZW4 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Acsl3Q9CZW4 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Acsl3Q9CZW4 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Acsl3Q9CZW4 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Acsl3Q9CZW4 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Acsl3Q9CZW4 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Acsl3Q9CZW4 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Acsl3Q9CZW4 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Acsl3Q9CZW4 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Acsl3Q9CZW4 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Acsl3Q9CZW4 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Acsl3Q9CZW4 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Acsl3Q9CZW4 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Acsl3Q9CZW4 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Acsl3Q9CZW4 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Acsl3Q9CZW4 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Acsl3Q9CZW4 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Acsl3Q9CZW4 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Acsl3Q9CZW4 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Acsl3Q9CZW4 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Acsl3Q9CZW4 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Acsl3Q9CZW4 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Acsl3Q9CZW4 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Acsl3Q9CZW4 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Acsl3Q9CZW4 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Acsl3Q9CZW4 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Acsl3Q9CZW4 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Acsl3Q9CZW4 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Acsl3Q9CZW4 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Acsl3Q9CZW4 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Acsl3Q9CZW4 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Acsl3Q9CZW4 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Acsl3Q9CZW4 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Acsl3Q9CZW4 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Acsl3Q9CZW4 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Acsl3Q9CZW4 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Acsl3Q9CZW4 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Acsl3Q9CZW4 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Acsl3Q9CZW4 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Acsl3Q9CZW4 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Acsl3Q9CZW4 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Acsl3Q9CZW4 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Acsl3Q9CZW4 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Acsl3Q9CZW4 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Acsl3Q9CZW4 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Acsl3Q9CZW4 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Acsl3Q9CZW4 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Acsl3Q9CZW4 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Acsl3Q9CZW4 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Acsl3Q9CZW4 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Acsl3Q9CZW4 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Acsl3Q9CZW4 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Acsl3Q9CZW4 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Acsl3Q9CZW4 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Acsl3Q9CZW4 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Acsl3Q9CZW4 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Acsl3Q9CZW4 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Acsl3Q9CZW4 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Acsl3Q9CZW4 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms