Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZJ9

Dnajc18, DnaJ homolog subfamily C member 18, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc18Q9CZJ9 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Dnajc18Q9CZJ9 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Dnajc18Q9CZJ9 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Dnajc18Q9CZJ9 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Dnajc18Q9CZJ9 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Dnajc18Q9CZJ9 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Dnajc18Q9CZJ9 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Dnajc18Q9CZJ9 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Dnajc18Q9CZJ9 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Dnajc18Q9CZJ9 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Dnajc18Q9CZJ9 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Dnajc18Q9CZJ9 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Dnajc18Q9CZJ9 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Dnajc18Q9CZJ9 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Dnajc18Q9CZJ9 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Dnajc18Q9CZJ9 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Dnajc18Q9CZJ9 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Dnajc18Q9CZJ9 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Dnajc18Q9CZJ9 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Dnajc18Q9CZJ9 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Dnajc18Q9CZJ9 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Dnajc18Q9CZJ9 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Dnajc18Q9CZJ9 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Dnajc18Q9CZJ9 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Dnajc18Q9CZJ9 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Dnajc18Q9CZJ9 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Dnajc18Q9CZJ9 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Dnajc18Q9CZJ9 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Dnajc18Q9CZJ9 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Dnajc18Q9CZJ9 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Dnajc18Q9CZJ9 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Dnajc18Q9CZJ9 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Dnajc18Q9CZJ9 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Dnajc18Q9CZJ9 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Dnajc18Q9CZJ9 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Dnajc18Q9CZJ9 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Dnajc18Q9CZJ9 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Dnajc18Q9CZJ9 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Dnajc18Q9CZJ9 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Dnajc18Q9CZJ9 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Dnajc18Q9CZJ9 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Dnajc18Q9CZJ9 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Dnajc18Q9CZJ9 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Dnajc18Q9CZJ9 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Dnajc18Q9CZJ9 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Dnajc18Q9CZJ9 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Dnajc18Q9CZJ9 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Dnajc18Q9CZJ9 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Dnajc18Q9CZJ9 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Dnajc18Q9CZJ9 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Dnajc18Q9CZJ9 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Dnajc18Q9CZJ9 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Dnajc18Q9CZJ9 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Dnajc18Q9CZJ9 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Dnajc18Q9CZJ9 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Dnajc18Q9CZJ9 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Dnajc18Q9CZJ9 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Dnajc18Q9CZJ9 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Dnajc18Q9CZJ9 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Dnajc18Q9CZJ9 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Dnajc18Q9CZJ9 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Dnajc18Q9CZJ9 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Dnajc18Q9CZJ9 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Dnajc18Q9CZJ9 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Dnajc18Q9CZJ9 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Dnajc18Q9CZJ9 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Dnajc18Q9CZJ9 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Dnajc18Q9CZJ9 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Dnajc18Q9CZJ9 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Dnajc18Q9CZJ9 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Dnajc18Q9CZJ9 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Dnajc18Q9CZJ9 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Dnajc18Q9CZJ9 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Dnajc18Q9CZJ9 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Dnajc18Q9CZJ9 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Dnajc18Q9CZJ9 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Dnajc18Q9CZJ9 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Dnajc18Q9CZJ9 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Dnajc18Q9CZJ9 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Dnajc18Q9CZJ9 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Dnajc18Q9CZJ9 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Dnajc18Q9CZJ9 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Dnajc18Q9CZJ9 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Dnajc18Q9CZJ9 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Dnajc18Q9CZJ9 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Dnajc18Q9CZJ9 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Dnajc18Q9CZJ9 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Dnajc18Q9CZJ9 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Dnajc18Q9CZJ9 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Dnajc18Q9CZJ9 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Dnajc18Q9CZJ9 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Dnajc18Q9CZJ9 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Dnajc18Q9CZJ9 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Dnajc18Q9CZJ9 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Dnajc18Q9CZJ9 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Dnajc18Q9CZJ9 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Dnajc18Q9CZJ9 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Dnajc18Q9CZJ9 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Dnajc18Q9CZJ9 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Dnajc18Q9CZJ9 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms