Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXW6

3100002H09Rik, RIKEN cDNA 3100002H09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
3100002H09RikQ9CXW6 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
3100002H09RikQ9CXW6 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
3100002H09RikQ9CXW6 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
3100002H09RikQ9CXW6 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
3100002H09RikQ9CXW6 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
3100002H09RikQ9CXW6 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
3100002H09RikQ9CXW6 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
3100002H09RikQ9CXW6 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
3100002H09RikQ9CXW6 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
3100002H09RikQ9CXW6 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
3100002H09RikQ9CXW6 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
3100002H09RikQ9CXW6 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
3100002H09RikQ9CXW6 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
3100002H09RikQ9CXW6 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
3100002H09RikQ9CXW6 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
3100002H09RikQ9CXW6 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
3100002H09RikQ9CXW6 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
3100002H09RikQ9CXW6 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
3100002H09RikQ9CXW6 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
3100002H09RikQ9CXW6 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
3100002H09RikQ9CXW6 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
3100002H09RikQ9CXW6 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
3100002H09RikQ9CXW6 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
3100002H09RikQ9CXW6 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
3100002H09RikQ9CXW6 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
3100002H09RikQ9CXW6 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
3100002H09RikQ9CXW6 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
3100002H09RikQ9CXW6 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
3100002H09RikQ9CXW6 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
3100002H09RikQ9CXW6 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
3100002H09RikQ9CXW6 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
3100002H09RikQ9CXW6 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
3100002H09RikQ9CXW6 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
3100002H09RikQ9CXW6 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
3100002H09RikQ9CXW6 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
3100002H09RikQ9CXW6 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
3100002H09RikQ9CXW6 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
3100002H09RikQ9CXW6 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
3100002H09RikQ9CXW6 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
3100002H09RikQ9CXW6 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
3100002H09RikQ9CXW6 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
3100002H09RikQ9CXW6 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
3100002H09RikQ9CXW6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
3100002H09RikQ9CXW6 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
3100002H09RikQ9CXW6 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
3100002H09RikQ9CXW6 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
3100002H09RikQ9CXW6 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
3100002H09RikQ9CXW6 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
3100002H09RikQ9CXW6 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
3100002H09RikQ9CXW6 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
3100002H09RikQ9CXW6 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
3100002H09RikQ9CXW6 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
3100002H09RikQ9CXW6 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
3100002H09RikQ9CXW6 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
3100002H09RikQ9CXW6 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
3100002H09RikQ9CXW6 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
3100002H09RikQ9CXW6 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
3100002H09RikQ9CXW6 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
3100002H09RikQ9CXW6 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
3100002H09RikQ9CXW6 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
3100002H09RikQ9CXW6 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
3100002H09RikQ9CXW6 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
3100002H09RikQ9CXW6 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
3100002H09RikQ9CXW6 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
3100002H09RikQ9CXW6 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
3100002H09RikQ9CXW6 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
3100002H09RikQ9CXW6 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
3100002H09RikQ9CXW6 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
3100002H09RikQ9CXW6 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
3100002H09RikQ9CXW6 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
3100002H09RikQ9CXW6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
3100002H09RikQ9CXW6 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
3100002H09RikQ9CXW6 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
3100002H09RikQ9CXW6 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
3100002H09RikQ9CXW6 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
3100002H09RikQ9CXW6 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
3100002H09RikQ9CXW6 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
3100002H09RikQ9CXW6 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
3100002H09RikQ9CXW6 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
3100002H09RikQ9CXW6 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
3100002H09RikQ9CXW6 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
3100002H09RikQ9CXW6 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
3100002H09RikQ9CXW6 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
3100002H09RikQ9CXW6 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
3100002H09RikQ9CXW6 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
3100002H09RikQ9CXW6 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
3100002H09RikQ9CXW6 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
3100002H09RikQ9CXW6 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
3100002H09RikQ9CXW6 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
3100002H09RikQ9CXW6 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
3100002H09RikQ9CXW6 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
3100002H09RikQ9CXW6 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
3100002H09RikQ9CXW6 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
3100002H09RikQ9CXW6 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
3100002H09RikQ9CXW6 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
3100002H09RikQ9CXW6 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
3100002H09RikQ9CXW6 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
3100002H09RikQ9CXW6 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
3100002H09RikQ9CXW6 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
3100002H09RikQ9CXW6 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 135.5 ms