Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXC3

Mgme1, Mitochondrial genome maintenance exonuclease 1, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mgme1Q9CXC3 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Mgme1Q9CXC3 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Mgme1Q9CXC3 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Mgme1Q9CXC3 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Mgme1Q9CXC3 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Mgme1Q9CXC3 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Mgme1Q9CXC3 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Mgme1Q9CXC3 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Mgme1Q9CXC3 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Mgme1Q9CXC3 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Mgme1Q9CXC3 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Mgme1Q9CXC3 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Mgme1Q9CXC3 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Mgme1Q9CXC3 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Mgme1Q9CXC3 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Mgme1Q9CXC3 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Mgme1Q9CXC3 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Mgme1Q9CXC3 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Mgme1Q9CXC3 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Mgme1Q9CXC3 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Mgme1Q9CXC3 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Mgme1Q9CXC3 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Mgme1Q9CXC3 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Mgme1Q9CXC3 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Mgme1Q9CXC3 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Mgme1Q9CXC3 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Mgme1Q9CXC3 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Mgme1Q9CXC3 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Mgme1Q9CXC3 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Mgme1Q9CXC3 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Mgme1Q9CXC3 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Mgme1Q9CXC3 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Mgme1Q9CXC3 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Mgme1Q9CXC3 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Mgme1Q9CXC3 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Mgme1Q9CXC3 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Mgme1Q9CXC3 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Mgme1Q9CXC3 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Mgme1Q9CXC3 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mgme1Q9CXC3 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mgme1Q9CXC3 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mgme1Q9CXC3 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mgme1Q9CXC3 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mgme1Q9CXC3 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Mgme1Q9CXC3 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Mgme1Q9CXC3 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Mgme1Q9CXC3 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Mgme1Q9CXC3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Mgme1Q9CXC3 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Mgme1Q9CXC3 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Mgme1Q9CXC3 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Mgme1Q9CXC3 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Mgme1Q9CXC3 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Mgme1Q9CXC3 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Mgme1Q9CXC3 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Mgme1Q9CXC3 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Mgme1Q9CXC3 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Mgme1Q9CXC3 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Mgme1Q9CXC3 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Mgme1Q9CXC3 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Mgme1Q9CXC3 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Mgme1Q9CXC3 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Mgme1Q9CXC3 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Mgme1Q9CXC3 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Mgme1Q9CXC3 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Mgme1Q9CXC3 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Mgme1Q9CXC3 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Mgme1Q9CXC3 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Mgme1Q9CXC3 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Mgme1Q9CXC3 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Mgme1Q9CXC3 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Mgme1Q9CXC3 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Mgme1Q9CXC3 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Mgme1Q9CXC3 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Mgme1Q9CXC3 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Mgme1Q9CXC3 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Mgme1Q9CXC3 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Mgme1Q9CXC3 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Mgme1Q9CXC3 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Mgme1Q9CXC3 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Mgme1Q9CXC3 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Mgme1Q9CXC3 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Mgme1Q9CXC3 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Mgme1Q9CXC3 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Mgme1Q9CXC3 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Mgme1Q9CXC3 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Mgme1Q9CXC3 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Mgme1Q9CXC3 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Mgme1Q9CXC3 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Mgme1Q9CXC3 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Mgme1Q9CXC3 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Mgme1Q9CXC3 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Mgme1Q9CXC3 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Mgme1Q9CXC3 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Mgme1Q9CXC3 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Mgme1Q9CXC3 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Mgme1Q9CXC3 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Mgme1Q9CXC3 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Mgme1Q9CXC3 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Mgme1Q9CXC3 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms