Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWW7

Cxxc1, CXXC-type zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxxc1Q9CWW7 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cxxc1Q9CWW7 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cxxc1Q9CWW7 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Cxxc1Q9CWW7 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cxxc1Q9CWW7 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cxxc1Q9CWW7 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cxxc1Q9CWW7 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cxxc1Q9CWW7 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cxxc1Q9CWW7 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cxxc1Q9CWW7 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cxxc1Q9CWW7 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cxxc1Q9CWW7 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cxxc1Q9CWW7 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cxxc1Q9CWW7 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Cxxc1Q9CWW7 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cxxc1Q9CWW7 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cxxc1Q9CWW7 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cxxc1Q9CWW7 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cxxc1Q9CWW7 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cxxc1Q9CWW7 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cxxc1Q9CWW7 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cxxc1Q9CWW7 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cxxc1Q9CWW7 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cxxc1Q9CWW7 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cxxc1Q9CWW7 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cxxc1Q9CWW7 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Cxxc1Q9CWW7 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cxxc1Q9CWW7 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cxxc1Q9CWW7 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cxxc1Q9CWW7 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cxxc1Q9CWW7 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cxxc1Q9CWW7 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cxxc1Q9CWW7 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cxxc1Q9CWW7 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cxxc1Q9CWW7 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cxxc1Q9CWW7 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Cxxc1Q9CWW7 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Cxxc1Q9CWW7 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cxxc1Q9CWW7 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cxxc1Q9CWW7 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cxxc1Q9CWW7 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cxxc1Q9CWW7 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cxxc1Q9CWW7 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cxxc1Q9CWW7 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Cxxc1Q9CWW7 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cxxc1Q9CWW7 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cxxc1Q9CWW7 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cxxc1Q9CWW7 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cxxc1Q9CWW7 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cxxc1Q9CWW7 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cxxc1Q9CWW7 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cxxc1Q9CWW7 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cxxc1Q9CWW7 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cxxc1Q9CWW7 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cxxc1Q9CWW7 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cxxc1Q9CWW7 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cxxc1Q9CWW7 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cxxc1Q9CWW7 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cxxc1Q9CWW7 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cxxc1Q9CWW7 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cxxc1Q9CWW7 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cxxc1Q9CWW7 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cxxc1Q9CWW7 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cxxc1Q9CWW7 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cxxc1Q9CWW7 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cxxc1Q9CWW7 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cxxc1Q9CWW7 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cxxc1Q9CWW7 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cxxc1Q9CWW7 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cxxc1Q9CWW7 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cxxc1Q9CWW7 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cxxc1Q9CWW7 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cxxc1Q9CWW7 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cxxc1Q9CWW7 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cxxc1Q9CWW7 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cxxc1Q9CWW7 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cxxc1Q9CWW7 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cxxc1Q9CWW7 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Cxxc1Q9CWW7 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cxxc1Q9CWW7 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cxxc1Q9CWW7 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cxxc1Q9CWW7 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cxxc1Q9CWW7 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cxxc1Q9CWW7 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cxxc1Q9CWW7 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cxxc1Q9CWW7 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cxxc1Q9CWW7 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cxxc1Q9CWW7 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cxxc1Q9CWW7 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cxxc1Q9CWW7 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cxxc1Q9CWW7 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cxxc1Q9CWW7 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cxxc1Q9CWW7 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cxxc1Q9CWW7 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cxxc1Q9CWW7 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cxxc1Q9CWW7 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cxxc1Q9CWW7 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cxxc1Q9CWW7 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cxxc1Q9CWW7 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cxxc1Q9CWW7 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms