Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM4

Pfdn1, Prefoldin subunit 1, mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn1Q9CWM4 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pfdn1Q9CWM4 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pfdn1Q9CWM4 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pfdn1Q9CWM4 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pfdn1Q9CWM4 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pfdn1Q9CWM4 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Pfdn1Q9CWM4 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pfdn1Q9CWM4 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pfdn1Q9CWM4 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pfdn1Q9CWM4 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pfdn1Q9CWM4 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pfdn1Q9CWM4 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pfdn1Q9CWM4 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pfdn1Q9CWM4 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pfdn1Q9CWM4 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pfdn1Q9CWM4 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pfdn1Q9CWM4 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pfdn1Q9CWM4 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pfdn1Q9CWM4 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pfdn1Q9CWM4 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pfdn1Q9CWM4 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pfdn1Q9CWM4 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pfdn1Q9CWM4 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pfdn1Q9CWM4 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pfdn1Q9CWM4 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pfdn1Q9CWM4 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pfdn1Q9CWM4 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pfdn1Q9CWM4 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Pfdn1Q9CWM4 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Pfdn1Q9CWM4 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pfdn1Q9CWM4 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pfdn1Q9CWM4 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pfdn1Q9CWM4 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pfdn1Q9CWM4 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pfdn1Q9CWM4 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pfdn1Q9CWM4 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pfdn1Q9CWM4 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pfdn1Q9CWM4 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pfdn1Q9CWM4 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pfdn1Q9CWM4 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pfdn1Q9CWM4 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pfdn1Q9CWM4 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pfdn1Q9CWM4 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pfdn1Q9CWM4 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pfdn1Q9CWM4 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Pfdn1Q9CWM4 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pfdn1Q9CWM4 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pfdn1Q9CWM4 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Pfdn1Q9CWM4 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pfdn1Q9CWM4 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pfdn1Q9CWM4 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pfdn1Q9CWM4 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pfdn1Q9CWM4 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pfdn1Q9CWM4 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pfdn1Q9CWM4 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pfdn1Q9CWM4 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pfdn1Q9CWM4 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pfdn1Q9CWM4 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pfdn1Q9CWM4 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pfdn1Q9CWM4 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pfdn1Q9CWM4 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pfdn1Q9CWM4 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pfdn1Q9CWM4 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Pfdn1Q9CWM4 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pfdn1Q9CWM4 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pfdn1Q9CWM4 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pfdn1Q9CWM4 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Pfdn1Q9CWM4 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pfdn1Q9CWM4 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pfdn1Q9CWM4 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pfdn1Q9CWM4 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pfdn1Q9CWM4 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pfdn1Q9CWM4 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pfdn1Q9CWM4 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Pfdn1Q9CWM4 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pfdn1Q9CWM4 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pfdn1Q9CWM4 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pfdn1Q9CWM4 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pfdn1Q9CWM4 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pfdn1Q9CWM4 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pfdn1Q9CWM4 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pfdn1Q9CWM4 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pfdn1Q9CWM4 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pfdn1Q9CWM4 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pfdn1Q9CWM4 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pfdn1Q9CWM4 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pfdn1Q9CWM4 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pfdn1Q9CWM4 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pfdn1Q9CWM4 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pfdn1Q9CWM4 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pfdn1Q9CWM4 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Pfdn1Q9CWM4 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pfdn1Q9CWM4 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pfdn1Q9CWM4 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pfdn1Q9CWM4 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pfdn1Q9CWM4 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pfdn1Q9CWM4 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pfdn1Q9CWM4 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Pfdn1Q9CWM4 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pfdn1Q9CWM4 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
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