Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUI2

4930535I16Rik, RIKEN cDNA 4930535I16 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930535I16RikQ9CUI2 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
4930535I16RikQ9CUI2 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
4930535I16RikQ9CUI2 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
4930535I16RikQ9CUI2 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
4930535I16RikQ9CUI2 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
4930535I16RikQ9CUI2 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
4930535I16RikQ9CUI2 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
4930535I16RikQ9CUI2 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
4930535I16RikQ9CUI2 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
4930535I16RikQ9CUI2 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
4930535I16RikQ9CUI2 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
4930535I16RikQ9CUI2 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
4930535I16RikQ9CUI2 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
4930535I16RikQ9CUI2 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
4930535I16RikQ9CUI2 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
4930535I16RikQ9CUI2 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
4930535I16RikQ9CUI2 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
4930535I16RikQ9CUI2 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
4930535I16RikQ9CUI2 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
4930535I16RikQ9CUI2 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
4930535I16RikQ9CUI2 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
4930535I16RikQ9CUI2 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
4930535I16RikQ9CUI2 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
4930535I16RikQ9CUI2 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
4930535I16RikQ9CUI2 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
4930535I16RikQ9CUI2 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
4930535I16RikQ9CUI2 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
4930535I16RikQ9CUI2 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
4930535I16RikQ9CUI2 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
4930535I16RikQ9CUI2 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
4930535I16RikQ9CUI2 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
4930535I16RikQ9CUI2 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
4930535I16RikQ9CUI2 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
4930535I16RikQ9CUI2 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
4930535I16RikQ9CUI2 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
4930535I16RikQ9CUI2 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
4930535I16RikQ9CUI2 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
4930535I16RikQ9CUI2 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
4930535I16RikQ9CUI2 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
4930535I16RikQ9CUI2 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
4930535I16RikQ9CUI2 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
4930535I16RikQ9CUI2 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
4930535I16RikQ9CUI2 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
4930535I16RikQ9CUI2 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
4930535I16RikQ9CUI2 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
4930535I16RikQ9CUI2 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
4930535I16RikQ9CUI2 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
4930535I16RikQ9CUI2 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
4930535I16RikQ9CUI2 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
4930535I16RikQ9CUI2 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
4930535I16RikQ9CUI2 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
4930535I16RikQ9CUI2 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
4930535I16RikQ9CUI2 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
4930535I16RikQ9CUI2 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
4930535I16RikQ9CUI2 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
4930535I16RikQ9CUI2 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
4930535I16RikQ9CUI2 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
4930535I16RikQ9CUI2 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
4930535I16RikQ9CUI2 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
4930535I16RikQ9CUI2 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
4930535I16RikQ9CUI2 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
4930535I16RikQ9CUI2 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
4930535I16RikQ9CUI2 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
4930535I16RikQ9CUI2 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
4930535I16RikQ9CUI2 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
4930535I16RikQ9CUI2 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
4930535I16RikQ9CUI2 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
4930535I16RikQ9CUI2 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
4930535I16RikQ9CUI2 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
4930535I16RikQ9CUI2 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
4930535I16RikQ9CUI2 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
4930535I16RikQ9CUI2 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
4930535I16RikQ9CUI2 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
4930535I16RikQ9CUI2 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
4930535I16RikQ9CUI2 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
4930535I16RikQ9CUI2 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
4930535I16RikQ9CUI2 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
4930535I16RikQ9CUI2 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
4930535I16RikQ9CUI2 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
4930535I16RikQ9CUI2 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
4930535I16RikQ9CUI2 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
4930535I16RikQ9CUI2 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
4930535I16RikQ9CUI2 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
4930535I16RikQ9CUI2 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
4930535I16RikQ9CUI2 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
4930535I16RikQ9CUI2 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
4930535I16RikQ9CUI2 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
4930535I16RikQ9CUI2 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
4930535I16RikQ9CUI2 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
4930535I16RikQ9CUI2 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
4930535I16RikQ9CUI2 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
4930535I16RikQ9CUI2 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
4930535I16RikQ9CUI2 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
4930535I16RikQ9CUI2 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
4930535I16RikQ9CUI2 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
4930535I16RikQ9CUI2 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
4930535I16RikQ9CUI2 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
4930535I16RikQ9CUI2 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
4930535I16RikQ9CUI2 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
4930535I16RikQ9CUI2 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms