Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRC3

UPF0235 protein C15orf40 homolog, mousemouse

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CRC3 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9CRC3 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q9CRC3 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q9CRC3 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q9CRC3 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q9CRC3 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Q9CRC3 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q9CRC3 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q9CRC3 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q9CRC3 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q9CRC3 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q9CRC3 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q9CRC3 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9CRC3 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9CRC3 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9CRC3 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9CRC3 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9CRC3 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9CRC3 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9CRC3 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9CRC3 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9CRC3 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9CRC3 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9CRC3 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9CRC3 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9CRC3 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9CRC3 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9CRC3 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9CRC3 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9CRC3 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9CRC3 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9CRC3 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9CRC3 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9CRC3 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9CRC3 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9CRC3 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9CRC3 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9CRC3 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9CRC3 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9CRC3 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9CRC3 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9CRC3 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9CRC3 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9CRC3 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9CRC3 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9CRC3 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9CRC3 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9CRC3 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9CRC3 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9CRC3 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9CRC3 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9CRC3 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9CRC3 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9CRC3 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9CRC3 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9CRC3 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9CRC3 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9CRC3 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9CRC3 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9CRC3 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9CRC3 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9CRC3 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9CRC3 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9CRC3 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9CRC3 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9CRC3 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9CRC3 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9CRC3 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9CRC3 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9CRC3 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Q9CRC3 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Q9CRC3 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9CRC3 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9CRC3 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9CRC3 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9CRC3 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9CRC3 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9CRC3 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9CRC3 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9CRC3 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9CRC3 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9CRC3 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9CRC3 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9CRC3 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9CRC3 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9CRC3 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9CRC3 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9CRC3 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9CRC3 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9CRC3 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9CRC3 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9CRC3 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9CRC3 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9CRC3 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9CRC3 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9CRC3 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9CRC3 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9CRC3 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9CRC3 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9CRC3 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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