Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQP3

Chchd5, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chchd5Q9CQP3 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chchd5Q9CQP3 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chchd5Q9CQP3 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chchd5Q9CQP3 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chchd5Q9CQP3 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chchd5Q9CQP3 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chchd5Q9CQP3 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chchd5Q9CQP3 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Chchd5Q9CQP3 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Chchd5Q9CQP3 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chchd5Q9CQP3 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chchd5Q9CQP3 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chchd5Q9CQP3 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chchd5Q9CQP3 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chchd5Q9CQP3 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chchd5Q9CQP3 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chchd5Q9CQP3 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chchd5Q9CQP3 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chchd5Q9CQP3 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chchd5Q9CQP3 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chchd5Q9CQP3 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chchd5Q9CQP3 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chchd5Q9CQP3 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chchd5Q9CQP3 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chchd5Q9CQP3 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chchd5Q9CQP3 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chchd5Q9CQP3 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chchd5Q9CQP3 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chchd5Q9CQP3 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chchd5Q9CQP3 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chchd5Q9CQP3 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chchd5Q9CQP3 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chchd5Q9CQP3 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chchd5Q9CQP3 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chchd5Q9CQP3 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chchd5Q9CQP3 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chchd5Q9CQP3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chchd5Q9CQP3 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chchd5Q9CQP3 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chchd5Q9CQP3 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chchd5Q9CQP3 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chchd5Q9CQP3 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chchd5Q9CQP3 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chchd5Q9CQP3 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chchd5Q9CQP3 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chchd5Q9CQP3 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chchd5Q9CQP3 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chchd5Q9CQP3 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chchd5Q9CQP3 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chchd5Q9CQP3 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chchd5Q9CQP3 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chchd5Q9CQP3 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Chchd5Q9CQP3 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chchd5Q9CQP3 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chchd5Q9CQP3 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chchd5Q9CQP3 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chchd5Q9CQP3 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chchd5Q9CQP3 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chchd5Q9CQP3 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chchd5Q9CQP3 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chchd5Q9CQP3 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chchd5Q9CQP3 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chchd5Q9CQP3 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chchd5Q9CQP3 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chchd5Q9CQP3 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chchd5Q9CQP3 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chchd5Q9CQP3 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chchd5Q9CQP3 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chchd5Q9CQP3 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chchd5Q9CQP3 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chchd5Q9CQP3 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chchd5Q9CQP3 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chchd5Q9CQP3 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chchd5Q9CQP3 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chchd5Q9CQP3 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chchd5Q9CQP3 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chchd5Q9CQP3 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chchd5Q9CQP3 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chchd5Q9CQP3 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chchd5Q9CQP3 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Chchd5Q9CQP3 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Chchd5Q9CQP3 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Chchd5Q9CQP3 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Chchd5Q9CQP3 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Chchd5Q9CQP3 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Chchd5Q9CQP3 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Chchd5Q9CQP3 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Chchd5Q9CQP3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Chchd5Q9CQP3 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Chchd5Q9CQP3 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Chchd5Q9CQP3 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Chchd5Q9CQP3 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Chchd5Q9CQP3 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Chchd5Q9CQP3 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Chchd5Q9CQP3 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Chchd5Q9CQP3 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Chchd5Q9CQP3 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Chchd5Q9CQP3 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Chchd5Q9CQP3 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Chchd5Q9CQP3 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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