Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL2

Ccer1, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer1Q9CQL2 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccer1Q9CQL2 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccer1Q9CQL2 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ccer1Q9CQL2 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ccer1Q9CQL2 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ccer1Q9CQL2 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ccer1Q9CQL2 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ccer1Q9CQL2 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ccer1Q9CQL2 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ccer1Q9CQL2 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccer1Q9CQL2 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccer1Q9CQL2 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccer1Q9CQL2 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccer1Q9CQL2 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccer1Q9CQL2 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccer1Q9CQL2 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccer1Q9CQL2 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccer1Q9CQL2 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccer1Q9CQL2 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccer1Q9CQL2 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccer1Q9CQL2 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccer1Q9CQL2 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccer1Q9CQL2 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccer1Q9CQL2 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccer1Q9CQL2 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccer1Q9CQL2 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccer1Q9CQL2 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccer1Q9CQL2 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccer1Q9CQL2 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccer1Q9CQL2 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccer1Q9CQL2 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccer1Q9CQL2 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccer1Q9CQL2 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccer1Q9CQL2 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccer1Q9CQL2 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccer1Q9CQL2 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccer1Q9CQL2 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccer1Q9CQL2 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccer1Q9CQL2 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccer1Q9CQL2 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccer1Q9CQL2 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccer1Q9CQL2 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccer1Q9CQL2 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccer1Q9CQL2 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccer1Q9CQL2 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccer1Q9CQL2 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccer1Q9CQL2 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccer1Q9CQL2 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccer1Q9CQL2 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccer1Q9CQL2 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccer1Q9CQL2 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccer1Q9CQL2 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccer1Q9CQL2 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccer1Q9CQL2 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccer1Q9CQL2 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccer1Q9CQL2 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccer1Q9CQL2 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccer1Q9CQL2 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccer1Q9CQL2 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccer1Q9CQL2 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccer1Q9CQL2 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccer1Q9CQL2 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccer1Q9CQL2 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccer1Q9CQL2 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccer1Q9CQL2 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccer1Q9CQL2 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.43
Ccer1Q9CQL2 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccer1Q9CQL2 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccer1Q9CQL2 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccer1Q9CQL2 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccer1Q9CQL2 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccer1Q9CQL2 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccer1Q9CQL2 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccer1Q9CQL2 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccer1Q9CQL2 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Ccer1Q9CQL2 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ccer1Q9CQL2 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccer1Q9CQL2 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC24■■□□□ 1.43
Ccer1Q9CQL2 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Ccer1Q9CQL2 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Ccer1Q9CQL2 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccer1Q9CQL2 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccer1Q9CQL2 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccer1Q9CQL2 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccer1Q9CQL2 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccer1Q9CQL2 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccer1Q9CQL2 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccer1Q9CQL2 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccer1Q9CQL2 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccer1Q9CQL2 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccer1Q9CQL2 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccer1Q9CQL2 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccer1Q9CQL2 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccer1Q9CQL2 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccer1Q9CQL2 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccer1Q9CQL2 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccer1Q9CQL2 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccer1Q9CQL2 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccer1Q9CQL2 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccer1Q9CQL2 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms