Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQG0

Tmed6, Transmembrane emp24 domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed6Q9CQG0 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmed6Q9CQG0 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmed6Q9CQG0 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmed6Q9CQG0 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmed6Q9CQG0 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmed6Q9CQG0 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmed6Q9CQG0 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmed6Q9CQG0 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmed6Q9CQG0 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmed6Q9CQG0 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmed6Q9CQG0 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmed6Q9CQG0 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmed6Q9CQG0 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmed6Q9CQG0 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmed6Q9CQG0 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmed6Q9CQG0 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmed6Q9CQG0 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmed6Q9CQG0 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmed6Q9CQG0 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmed6Q9CQG0 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmed6Q9CQG0 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmed6Q9CQG0 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmed6Q9CQG0 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmed6Q9CQG0 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmed6Q9CQG0 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmed6Q9CQG0 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmed6Q9CQG0 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmed6Q9CQG0 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmed6Q9CQG0 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmed6Q9CQG0 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmed6Q9CQG0 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmed6Q9CQG0 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmed6Q9CQG0 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmed6Q9CQG0 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmed6Q9CQG0 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmed6Q9CQG0 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmed6Q9CQG0 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmed6Q9CQG0 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmed6Q9CQG0 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmed6Q9CQG0 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmed6Q9CQG0 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmed6Q9CQG0 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmed6Q9CQG0 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmed6Q9CQG0 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmed6Q9CQG0 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmed6Q9CQG0 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmed6Q9CQG0 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmed6Q9CQG0 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmed6Q9CQG0 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmed6Q9CQG0 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmed6Q9CQG0 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmed6Q9CQG0 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmed6Q9CQG0 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmed6Q9CQG0 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmed6Q9CQG0 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmed6Q9CQG0 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmed6Q9CQG0 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmed6Q9CQG0 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmed6Q9CQG0 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmed6Q9CQG0 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmed6Q9CQG0 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmed6Q9CQG0 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmed6Q9CQG0 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmed6Q9CQG0 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmed6Q9CQG0 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmed6Q9CQG0 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmed6Q9CQG0 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmed6Q9CQG0 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmed6Q9CQG0 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmed6Q9CQG0 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmed6Q9CQG0 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmed6Q9CQG0 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmed6Q9CQG0 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmed6Q9CQG0 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmed6Q9CQG0 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmed6Q9CQG0 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmed6Q9CQG0 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmed6Q9CQG0 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmed6Q9CQG0 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmed6Q9CQG0 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmed6Q9CQG0 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmed6Q9CQG0 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmed6Q9CQG0 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmed6Q9CQG0 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmed6Q9CQG0 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmed6Q9CQG0 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tmed6Q9CQG0 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tmed6Q9CQG0 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tmed6Q9CQG0 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tmed6Q9CQG0 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tmed6Q9CQG0 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmed6Q9CQG0 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmed6Q9CQG0 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmed6Q9CQG0 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmed6Q9CQG0 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmed6Q9CQG0 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmed6Q9CQG0 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmed6Q9CQG0 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmed6Q9CQG0 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmed6Q9CQG0 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms