Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF4

Uncharacterized protein C6orf203 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQF4 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Q9CQF4 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Q9CQF4 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q9CQF4 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q9CQF4 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q9CQF4 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q9CQF4 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q9CQF4 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q9CQF4 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q9CQF4 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q9CQF4 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q9CQF4 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q9CQF4 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Q9CQF4 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Q9CQF4 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Q9CQF4 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Q9CQF4 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Q9CQF4 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Q9CQF4 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Q9CQF4 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Q9CQF4 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Q9CQF4 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Q9CQF4 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Q9CQF4 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Q9CQF4 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Q9CQF4 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Q9CQF4 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Q9CQF4 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Q9CQF4 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Q9CQF4 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Q9CQF4 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Q9CQF4 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Q9CQF4 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Q9CQF4 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Q9CQF4 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Q9CQF4 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Q9CQF4 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Q9CQF4 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Q9CQF4 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Q9CQF4 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Q9CQF4 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Q9CQF4 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Q9CQF4 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Q9CQF4 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Q9CQF4 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Q9CQF4 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Q9CQF4 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Q9CQF4 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Q9CQF4 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q9CQF4 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q9CQF4 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q9CQF4 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q9CQF4 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q9CQF4 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q9CQF4 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q9CQF4 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q9CQF4 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q9CQF4 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q9CQF4 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q9CQF4 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q9CQF4 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q9CQF4 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q9CQF4 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q9CQF4 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q9CQF4 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q9CQF4 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q9CQF4 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q9CQF4 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q9CQF4 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q9CQF4 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q9CQF4 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q9CQF4 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q9CQF4 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q9CQF4 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q9CQF4 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q9CQF4 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q9CQF4 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q9CQF4 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q9CQF4 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q9CQF4 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q9CQF4 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q9CQF4 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q9CQF4 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q9CQF4 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q9CQF4 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q9CQF4 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q9CQF4 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q9CQF4 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q9CQF4 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q9CQF4 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q9CQF4 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q9CQF4 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q9CQF4 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q9CQF4 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Q9CQF4 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Q9CQF4 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Q9CQF4 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q9CQF4 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Q9CQF4 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q9CQF4 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms