Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE1

Nipsnap3b, Protein NipSnap homolog 3B, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3bQ9CQE1 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nipsnap3bQ9CQE1 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nipsnap3bQ9CQE1 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Nipsnap3bQ9CQE1 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nipsnap3bQ9CQE1 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nipsnap3bQ9CQE1 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nipsnap3bQ9CQE1 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nipsnap3bQ9CQE1 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nipsnap3bQ9CQE1 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nipsnap3bQ9CQE1 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nipsnap3bQ9CQE1 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nipsnap3bQ9CQE1 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nipsnap3bQ9CQE1 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nipsnap3bQ9CQE1 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nipsnap3bQ9CQE1 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nipsnap3bQ9CQE1 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nipsnap3bQ9CQE1 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nipsnap3bQ9CQE1 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nipsnap3bQ9CQE1 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nipsnap3bQ9CQE1 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nipsnap3bQ9CQE1 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nipsnap3bQ9CQE1 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nipsnap3bQ9CQE1 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nipsnap3bQ9CQE1 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nipsnap3bQ9CQE1 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nipsnap3bQ9CQE1 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nipsnap3bQ9CQE1 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nipsnap3bQ9CQE1 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Nipsnap3bQ9CQE1 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Nipsnap3bQ9CQE1 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nipsnap3bQ9CQE1 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nipsnap3bQ9CQE1 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nipsnap3bQ9CQE1 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nipsnap3bQ9CQE1 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nipsnap3bQ9CQE1 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nipsnap3bQ9CQE1 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nipsnap3bQ9CQE1 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nipsnap3bQ9CQE1 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nipsnap3bQ9CQE1 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Nipsnap3bQ9CQE1 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nipsnap3bQ9CQE1 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Nipsnap3bQ9CQE1 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nipsnap3bQ9CQE1 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nipsnap3bQ9CQE1 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nipsnap3bQ9CQE1 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nipsnap3bQ9CQE1 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nipsnap3bQ9CQE1 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nipsnap3bQ9CQE1 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nipsnap3bQ9CQE1 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nipsnap3bQ9CQE1 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nipsnap3bQ9CQE1 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nipsnap3bQ9CQE1 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nipsnap3bQ9CQE1 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nipsnap3bQ9CQE1 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nipsnap3bQ9CQE1 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nipsnap3bQ9CQE1 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nipsnap3bQ9CQE1 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nipsnap3bQ9CQE1 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Nipsnap3bQ9CQE1 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nipsnap3bQ9CQE1 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nipsnap3bQ9CQE1 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nipsnap3bQ9CQE1 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nipsnap3bQ9CQE1 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Nipsnap3bQ9CQE1 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nipsnap3bQ9CQE1 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nipsnap3bQ9CQE1 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nipsnap3bQ9CQE1 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nipsnap3bQ9CQE1 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nipsnap3bQ9CQE1 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nipsnap3bQ9CQE1 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nipsnap3bQ9CQE1 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Nipsnap3bQ9CQE1 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Nipsnap3bQ9CQE1 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nipsnap3bQ9CQE1 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nipsnap3bQ9CQE1 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nipsnap3bQ9CQE1 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nipsnap3bQ9CQE1 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Nipsnap3bQ9CQE1 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nipsnap3bQ9CQE1 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nipsnap3bQ9CQE1 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nipsnap3bQ9CQE1 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nipsnap3bQ9CQE1 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nipsnap3bQ9CQE1 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nipsnap3bQ9CQE1 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nipsnap3bQ9CQE1 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nipsnap3bQ9CQE1 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nipsnap3bQ9CQE1 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nipsnap3bQ9CQE1 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nipsnap3bQ9CQE1 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nipsnap3bQ9CQE1 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nipsnap3bQ9CQE1 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nipsnap3bQ9CQE1 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nipsnap3bQ9CQE1 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms