Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD0

Rpl39l, RIKEN cDNA 4930517K11, mousemouse

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Length 51 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl39lQ9CQD0 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpl39lQ9CQD0 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpl39lQ9CQD0 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpl39lQ9CQD0 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpl39lQ9CQD0 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpl39lQ9CQD0 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpl39lQ9CQD0 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpl39lQ9CQD0 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpl39lQ9CQD0 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpl39lQ9CQD0 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpl39lQ9CQD0 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpl39lQ9CQD0 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpl39lQ9CQD0 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpl39lQ9CQD0 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpl39lQ9CQD0 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpl39lQ9CQD0 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpl39lQ9CQD0 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpl39lQ9CQD0 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpl39lQ9CQD0 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpl39lQ9CQD0 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Rpl39lQ9CQD0 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpl39lQ9CQD0 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpl39lQ9CQD0 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Rpl39lQ9CQD0 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpl39lQ9CQD0 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpl39lQ9CQD0 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpl39lQ9CQD0 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpl39lQ9CQD0 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Rpl39lQ9CQD0 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpl39lQ9CQD0 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpl39lQ9CQD0 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpl39lQ9CQD0 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpl39lQ9CQD0 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpl39lQ9CQD0 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpl39lQ9CQD0 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpl39lQ9CQD0 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Rpl39lQ9CQD0 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpl39lQ9CQD0 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpl39lQ9CQD0 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpl39lQ9CQD0 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpl39lQ9CQD0 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpl39lQ9CQD0 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpl39lQ9CQD0 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpl39lQ9CQD0 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpl39lQ9CQD0 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpl39lQ9CQD0 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpl39lQ9CQD0 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpl39lQ9CQD0 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpl39lQ9CQD0 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Rpl39lQ9CQD0 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpl39lQ9CQD0 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpl39lQ9CQD0 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpl39lQ9CQD0 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpl39lQ9CQD0 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpl39lQ9CQD0 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpl39lQ9CQD0 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpl39lQ9CQD0 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpl39lQ9CQD0 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Rpl39lQ9CQD0 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Rpl39lQ9CQD0 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl39lQ9CQD0 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl39lQ9CQD0 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl39lQ9CQD0 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl39lQ9CQD0 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl39lQ9CQD0 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Rpl39lQ9CQD0 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl39lQ9CQD0 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl39lQ9CQD0 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl39lQ9CQD0 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl39lQ9CQD0 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl39lQ9CQD0 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl39lQ9CQD0 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl39lQ9CQD0 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl39lQ9CQD0 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpl39lQ9CQD0 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpl39lQ9CQD0 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpl39lQ9CQD0 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpl39lQ9CQD0 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpl39lQ9CQD0 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpl39lQ9CQD0 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpl39lQ9CQD0 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpl39lQ9CQD0 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpl39lQ9CQD0 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpl39lQ9CQD0 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpl39lQ9CQD0 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpl39lQ9CQD0 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpl39lQ9CQD0 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpl39lQ9CQD0 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
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