Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Atg3Q9CPX6 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Atg3Q9CPX6 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Atg3Q9CPX6 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Atg3Q9CPX6 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Atg3Q9CPX6 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Atg3Q9CPX6 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Atg3Q9CPX6 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Atg3Q9CPX6 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Atg3Q9CPX6 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Atg3Q9CPX6 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Atg3Q9CPX6 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Atg3Q9CPX6 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Atg3Q9CPX6 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Atg3Q9CPX6 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Atg3Q9CPX6 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Atg3Q9CPX6 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Atg3Q9CPX6 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Atg3Q9CPX6 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Atg3Q9CPX6 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Atg3Q9CPX6 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Atg3Q9CPX6 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Atg3Q9CPX6 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Atg3Q9CPX6 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Atg3Q9CPX6 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Atg3Q9CPX6 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Atg3Q9CPX6 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Atg3Q9CPX6 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Atg3Q9CPX6 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Atg3Q9CPX6 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Atg3Q9CPX6 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Atg3Q9CPX6 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Atg3Q9CPX6 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Atg3Q9CPX6 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Atg3Q9CPX6 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Atg3Q9CPX6 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Atg3Q9CPX6 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Atg3Q9CPX6 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Atg3Q9CPX6 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Atg3Q9CPX6 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Atg3Q9CPX6 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Atg3Q9CPX6 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Atg3Q9CPX6 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Atg3Q9CPX6 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Atg3Q9CPX6 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Atg3Q9CPX6 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Atg3Q9CPX6 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Atg3Q9CPX6 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Atg3Q9CPX6 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Atg3Q9CPX6 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Atg3Q9CPX6 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Atg3Q9CPX6 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Atg3Q9CPX6 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Atg3Q9CPX6 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Atg3Q9CPX6 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Atg3Q9CPX6 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Atg3Q9CPX6 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Atg3Q9CPX6 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Atg3Q9CPX6 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Atg3Q9CPX6 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Atg3Q9CPX6 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Atg3Q9CPX6 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Atg3Q9CPX6 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Atg3Q9CPX6 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Atg3Q9CPX6 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Atg3Q9CPX6 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Atg3Q9CPX6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Atg3Q9CPX6 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Atg3Q9CPX6 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Atg3Q9CPX6 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Atg3Q9CPX6 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Atg3Q9CPX6 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Atg3Q9CPX6 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Atg3Q9CPX6 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Atg3Q9CPX6 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Atg3Q9CPX6 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Atg3Q9CPX6 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Atg3Q9CPX6 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Atg3Q9CPX6 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Atg3Q9CPX6 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Atg3Q9CPX6 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Atg3Q9CPX6 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Atg3Q9CPX6 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Atg3Q9CPX6 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Atg3Q9CPX6 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Atg3Q9CPX6 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Atg3Q9CPX6 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Atg3Q9CPX6 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Atg3Q9CPX6 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Atg3Q9CPX6 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Atg3Q9CPX6 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Atg3Q9CPX6 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Atg3Q9CPX6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Atg3Q9CPX6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Atg3Q9CPX6 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Atg3Q9CPX6 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Atg3Q9CPX6 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Atg3Q9CPX6 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Atg3Q9CPX6 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Atg3Q9CPX6 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.9 ms