Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR7

Sike1, Suppressor of IKBKE 1, mousemouse

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Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sike1Q9CPR7 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sike1Q9CPR7 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sike1Q9CPR7 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sike1Q9CPR7 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sike1Q9CPR7 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sike1Q9CPR7 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sike1Q9CPR7 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sike1Q9CPR7 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sike1Q9CPR7 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sike1Q9CPR7 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sike1Q9CPR7 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sike1Q9CPR7 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sike1Q9CPR7 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sike1Q9CPR7 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sike1Q9CPR7 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sike1Q9CPR7 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sike1Q9CPR7 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sike1Q9CPR7 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sike1Q9CPR7 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sike1Q9CPR7 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sike1Q9CPR7 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sike1Q9CPR7 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sike1Q9CPR7 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sike1Q9CPR7 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sike1Q9CPR7 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sike1Q9CPR7 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sike1Q9CPR7 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sike1Q9CPR7 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sike1Q9CPR7 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sike1Q9CPR7 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sike1Q9CPR7 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Sike1Q9CPR7 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sike1Q9CPR7 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Sike1Q9CPR7 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Sike1Q9CPR7 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sike1Q9CPR7 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sike1Q9CPR7 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sike1Q9CPR7 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sike1Q9CPR7 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sike1Q9CPR7 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sike1Q9CPR7 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sike1Q9CPR7 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sike1Q9CPR7 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sike1Q9CPR7 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sike1Q9CPR7 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sike1Q9CPR7 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sike1Q9CPR7 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sike1Q9CPR7 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sike1Q9CPR7 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sike1Q9CPR7 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sike1Q9CPR7 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sike1Q9CPR7 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Sike1Q9CPR7 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Sike1Q9CPR7 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
Sike1Q9CPR7 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sike1Q9CPR7 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sike1Q9CPR7 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sike1Q9CPR7 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sike1Q9CPR7 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sike1Q9CPR7 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sike1Q9CPR7 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sike1Q9CPR7 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sike1Q9CPR7 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sike1Q9CPR7 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sike1Q9CPR7 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sike1Q9CPR7 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sike1Q9CPR7 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Sike1Q9CPR7 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sike1Q9CPR7 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sike1Q9CPR7 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sike1Q9CPR7 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sike1Q9CPR7 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sike1Q9CPR7 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sike1Q9CPR7 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sike1Q9CPR7 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sike1Q9CPR7 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sike1Q9CPR7 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sike1Q9CPR7 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sike1Q9CPR7 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sike1Q9CPR7 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sike1Q9CPR7 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sike1Q9CPR7 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sike1Q9CPR7 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sike1Q9CPR7 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sike1Q9CPR7 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sike1Q9CPR7 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sike1Q9CPR7 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sike1Q9CPR7 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sike1Q9CPR7 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sike1Q9CPR7 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sike1Q9CPR7 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sike1Q9CPR7 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sike1Q9CPR7 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sike1Q9CPR7 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sike1Q9CPR7 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sike1Q9CPR7 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sike1Q9CPR7 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sike1Q9CPR7 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sike1Q9CPR7 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sike1Q9CPR7 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.2 ms