Protein–RNA interactions for Protein: Q99PU7

Bap1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase BAP1, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bap1Q99PU7 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Bap1Q99PU7 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Bap1Q99PU7 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Bap1Q99PU7 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Bap1Q99PU7 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Bap1Q99PU7 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Bap1Q99PU7 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Bap1Q99PU7 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Bap1Q99PU7 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Bap1Q99PU7 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Bap1Q99PU7 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Bap1Q99PU7 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Bap1Q99PU7 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Bap1Q99PU7 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Bap1Q99PU7 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Bap1Q99PU7 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Bap1Q99PU7 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Bap1Q99PU7 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Bap1Q99PU7 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Bap1Q99PU7 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Bap1Q99PU7 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Bap1Q99PU7 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Bap1Q99PU7 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Bap1Q99PU7 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Bap1Q99PU7 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Bap1Q99PU7 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Bap1Q99PU7 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Bap1Q99PU7 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Bap1Q99PU7 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Bap1Q99PU7 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Bap1Q99PU7 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Bap1Q99PU7 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Bap1Q99PU7 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Bap1Q99PU7 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Bap1Q99PU7 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Bap1Q99PU7 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Bap1Q99PU7 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Bap1Q99PU7 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Bap1Q99PU7 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Bap1Q99PU7 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Bap1Q99PU7 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Bap1Q99PU7 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Bap1Q99PU7 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Bap1Q99PU7 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Bap1Q99PU7 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Bap1Q99PU7 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Bap1Q99PU7 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Bap1Q99PU7 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Bap1Q99PU7 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Bap1Q99PU7 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Bap1Q99PU7 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Bap1Q99PU7 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Bap1Q99PU7 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Bap1Q99PU7 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Bap1Q99PU7 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Bap1Q99PU7 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Bap1Q99PU7 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Bap1Q99PU7 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Bap1Q99PU7 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Bap1Q99PU7 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Bap1Q99PU7 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Bap1Q99PU7 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Bap1Q99PU7 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Bap1Q99PU7 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Bap1Q99PU7 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Bap1Q99PU7 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Bap1Q99PU7 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Bap1Q99PU7 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Bap1Q99PU7 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Bap1Q99PU7 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Bap1Q99PU7 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Bap1Q99PU7 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Bap1Q99PU7 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Bap1Q99PU7 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Bap1Q99PU7 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Bap1Q99PU7 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Bap1Q99PU7 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Bap1Q99PU7 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Bap1Q99PU7 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Bap1Q99PU7 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Bap1Q99PU7 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Bap1Q99PU7 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Bap1Q99PU7 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Bap1Q99PU7 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Bap1Q99PU7 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Bap1Q99PU7 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Bap1Q99PU7 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Bap1Q99PU7 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Bap1Q99PU7 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Bap1Q99PU7 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Bap1Q99PU7 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Bap1Q99PU7 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Bap1Q99PU7 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Bap1Q99PU7 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Bap1Q99PU7 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Bap1Q99PU7 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Bap1Q99PU7 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Bap1Q99PU7 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Bap1Q99PU7 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Bap1Q99PU7 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms