Protein–RNA interactions for Protein: Q99PS0

Krt23, Keratin, type I cytoskeletal 23, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt23Q99PS0 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Krt23Q99PS0 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Krt23Q99PS0 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Krt23Q99PS0 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Krt23Q99PS0 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Krt23Q99PS0 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Krt23Q99PS0 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Krt23Q99PS0 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Krt23Q99PS0 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Krt23Q99PS0 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Krt23Q99PS0 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Krt23Q99PS0 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Krt23Q99PS0 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Krt23Q99PS0 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Krt23Q99PS0 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Krt23Q99PS0 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Krt23Q99PS0 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Krt23Q99PS0 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Krt23Q99PS0 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Krt23Q99PS0 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Krt23Q99PS0 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Krt23Q99PS0 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Krt23Q99PS0 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Krt23Q99PS0 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Krt23Q99PS0 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Krt23Q99PS0 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Krt23Q99PS0 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Krt23Q99PS0 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Krt23Q99PS0 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Krt23Q99PS0 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Krt23Q99PS0 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Krt23Q99PS0 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Krt23Q99PS0 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Krt23Q99PS0 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Krt23Q99PS0 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Krt23Q99PS0 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Krt23Q99PS0 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Krt23Q99PS0 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Krt23Q99PS0 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Krt23Q99PS0 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Krt23Q99PS0 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Krt23Q99PS0 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Krt23Q99PS0 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Krt23Q99PS0 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Krt23Q99PS0 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Krt23Q99PS0 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Krt23Q99PS0 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Krt23Q99PS0 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Krt23Q99PS0 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Krt23Q99PS0 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Krt23Q99PS0 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Krt23Q99PS0 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Krt23Q99PS0 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Krt23Q99PS0 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Krt23Q99PS0 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Krt23Q99PS0 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Krt23Q99PS0 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Krt23Q99PS0 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Krt23Q99PS0 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Krt23Q99PS0 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Krt23Q99PS0 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Krt23Q99PS0 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Krt23Q99PS0 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Krt23Q99PS0 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Krt23Q99PS0 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Krt23Q99PS0 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Krt23Q99PS0 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Krt23Q99PS0 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Krt23Q99PS0 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Krt23Q99PS0 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Krt23Q99PS0 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Krt23Q99PS0 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Krt23Q99PS0 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Krt23Q99PS0 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Krt23Q99PS0 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Krt23Q99PS0 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Krt23Q99PS0 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Krt23Q99PS0 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Krt23Q99PS0 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Krt23Q99PS0 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Krt23Q99PS0 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Krt23Q99PS0 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Krt23Q99PS0 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Krt23Q99PS0 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Krt23Q99PS0 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Krt23Q99PS0 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Krt23Q99PS0 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Krt23Q99PS0 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Krt23Q99PS0 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Krt23Q99PS0 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Krt23Q99PS0 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Krt23Q99PS0 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Krt23Q99PS0 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Krt23Q99PS0 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Krt23Q99PS0 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Krt23Q99PS0 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Krt23Q99PS0 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Krt23Q99PS0 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Krt23Q99PS0 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Krt23Q99PS0 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms