Protein–RNA interactions for Protein: Q99PM3

Gtf2a1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2a1Q99PM3 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gtf2a1Q99PM3 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gtf2a1Q99PM3 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gtf2a1Q99PM3 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gtf2a1Q99PM3 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gtf2a1Q99PM3 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gtf2a1Q99PM3 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gtf2a1Q99PM3 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.31
Gtf2a1Q99PM3 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gtf2a1Q99PM3 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gtf2a1Q99PM3 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gtf2a1Q99PM3 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gtf2a1Q99PM3 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gtf2a1Q99PM3 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gtf2a1Q99PM3 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gtf2a1Q99PM3 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Gtf2a1Q99PM3 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gtf2a1Q99PM3 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gtf2a1Q99PM3 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gtf2a1Q99PM3 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Gtf2a1Q99PM3 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gtf2a1Q99PM3 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gtf2a1Q99PM3 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gtf2a1Q99PM3 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gtf2a1Q99PM3 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gtf2a1Q99PM3 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gtf2a1Q99PM3 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gtf2a1Q99PM3 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Gtf2a1Q99PM3 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gtf2a1Q99PM3 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gtf2a1Q99PM3 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gtf2a1Q99PM3 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gtf2a1Q99PM3 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gtf2a1Q99PM3 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gtf2a1Q99PM3 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gtf2a1Q99PM3 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gtf2a1Q99PM3 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gtf2a1Q99PM3 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gtf2a1Q99PM3 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gtf2a1Q99PM3 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gtf2a1Q99PM3 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gtf2a1Q99PM3 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gtf2a1Q99PM3 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gtf2a1Q99PM3 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gtf2a1Q99PM3 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gtf2a1Q99PM3 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gtf2a1Q99PM3 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gtf2a1Q99PM3 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gtf2a1Q99PM3 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gtf2a1Q99PM3 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gtf2a1Q99PM3 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gtf2a1Q99PM3 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gtf2a1Q99PM3 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gtf2a1Q99PM3 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gtf2a1Q99PM3 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gtf2a1Q99PM3 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gtf2a1Q99PM3 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gtf2a1Q99PM3 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gtf2a1Q99PM3 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gtf2a1Q99PM3 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gtf2a1Q99PM3 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gtf2a1Q99PM3 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Gtf2a1Q99PM3 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gtf2a1Q99PM3 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gtf2a1Q99PM3 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gtf2a1Q99PM3 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gtf2a1Q99PM3 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gtf2a1Q99PM3 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gtf2a1Q99PM3 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gtf2a1Q99PM3 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gtf2a1Q99PM3 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gtf2a1Q99PM3 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gtf2a1Q99PM3 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gtf2a1Q99PM3 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Gtf2a1Q99PM3 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gtf2a1Q99PM3 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gtf2a1Q99PM3 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gtf2a1Q99PM3 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gtf2a1Q99PM3 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gtf2a1Q99PM3 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gtf2a1Q99PM3 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gtf2a1Q99PM3 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gtf2a1Q99PM3 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gtf2a1Q99PM3 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gtf2a1Q99PM3 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gtf2a1Q99PM3 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gtf2a1Q99PM3 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gtf2a1Q99PM3 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gtf2a1Q99PM3 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gtf2a1Q99PM3 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gtf2a1Q99PM3 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gtf2a1Q99PM3 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gtf2a1Q99PM3 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gtf2a1Q99PM3 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gtf2a1Q99PM3 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gtf2a1Q99PM3 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gtf2a1Q99PM3 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gtf2a1Q99PM3 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gtf2a1Q99PM3 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gtf2a1Q99PM3 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms