Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL7

Scd3, Acyl-CoA desaturase 3, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scd3Q99PL7 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Scd3Q99PL7 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Scd3Q99PL7 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Scd3Q99PL7 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Scd3Q99PL7 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Scd3Q99PL7 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Scd3Q99PL7 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Scd3Q99PL7 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Scd3Q99PL7 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Scd3Q99PL7 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Scd3Q99PL7 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Scd3Q99PL7 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Scd3Q99PL7 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Scd3Q99PL7 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Scd3Q99PL7 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Scd3Q99PL7 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Scd3Q99PL7 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Scd3Q99PL7 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Scd3Q99PL7 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Scd3Q99PL7 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Scd3Q99PL7 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Scd3Q99PL7 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Scd3Q99PL7 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Scd3Q99PL7 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Scd3Q99PL7 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Scd3Q99PL7 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Scd3Q99PL7 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Scd3Q99PL7 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Scd3Q99PL7 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Scd3Q99PL7 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Scd3Q99PL7 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Scd3Q99PL7 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Scd3Q99PL7 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Scd3Q99PL7 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Scd3Q99PL7 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Scd3Q99PL7 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Scd3Q99PL7 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Scd3Q99PL7 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Scd3Q99PL7 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Scd3Q99PL7 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Scd3Q99PL7 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Scd3Q99PL7 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Scd3Q99PL7 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Scd3Q99PL7 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Scd3Q99PL7 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Scd3Q99PL7 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Scd3Q99PL7 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Scd3Q99PL7 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Scd3Q99PL7 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Scd3Q99PL7 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Scd3Q99PL7 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Scd3Q99PL7 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Scd3Q99PL7 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Scd3Q99PL7 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Scd3Q99PL7 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Scd3Q99PL7 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Scd3Q99PL7 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Scd3Q99PL7 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Scd3Q99PL7 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Scd3Q99PL7 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Scd3Q99PL7 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Scd3Q99PL7 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Scd3Q99PL7 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Scd3Q99PL7 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Scd3Q99PL7 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Scd3Q99PL7 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Scd3Q99PL7 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Scd3Q99PL7 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Scd3Q99PL7 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Scd3Q99PL7 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Scd3Q99PL7 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Scd3Q99PL7 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Scd3Q99PL7 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Scd3Q99PL7 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Scd3Q99PL7 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Scd3Q99PL7 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Scd3Q99PL7 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Scd3Q99PL7 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Scd3Q99PL7 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Scd3Q99PL7 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Scd3Q99PL7 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Scd3Q99PL7 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Scd3Q99PL7 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Scd3Q99PL7 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Scd3Q99PL7 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Scd3Q99PL7 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Scd3Q99PL7 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Scd3Q99PL7 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Scd3Q99PL7 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Scd3Q99PL7 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Scd3Q99PL7 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Scd3Q99PL7 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Scd3Q99PL7 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Scd3Q99PL7 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Scd3Q99PL7 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Scd3Q99PL7 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Scd3Q99PL7 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Scd3Q99PL7 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Scd3Q99PL7 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Scd3Q99PL7 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms