Protein–RNA interactions for Protein: Q99NE5

Rims1, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rims1Q99NE5 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Rims1Q99NE5 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Rims1Q99NE5 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Rims1Q99NE5 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Rims1Q99NE5 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Rims1Q99NE5 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Rims1Q99NE5 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Rims1Q99NE5 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Rims1Q99NE5 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Rims1Q99NE5 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Rims1Q99NE5 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Rims1Q99NE5 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
Rims1Q99NE5 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Rims1Q99NE5 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Rims1Q99NE5 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Rims1Q99NE5 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Rims1Q99NE5 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Rims1Q99NE5 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Rims1Q99NE5 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Rims1Q99NE5 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Rims1Q99NE5 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Rims1Q99NE5 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Rims1Q99NE5 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Rims1Q99NE5 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Rims1Q99NE5 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Rims1Q99NE5 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Rims1Q99NE5 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Rims1Q99NE5 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Rims1Q99NE5 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Rims1Q99NE5 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Rims1Q99NE5 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Rims1Q99NE5 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Rims1Q99NE5 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Rims1Q99NE5 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
Rims1Q99NE5 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Rims1Q99NE5 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Rims1Q99NE5 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Rims1Q99NE5 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Rims1Q99NE5 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Rims1Q99NE5 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Rims1Q99NE5 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Rims1Q99NE5 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Rims1Q99NE5 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Rims1Q99NE5 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Rims1Q99NE5 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Rims1Q99NE5 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Rims1Q99NE5 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Rims1Q99NE5 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Rims1Q99NE5 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Rims1Q99NE5 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
Rims1Q99NE5 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
Rims1Q99NE5 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
Rims1Q99NE5 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Rims1Q99NE5 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Rims1Q99NE5 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Rims1Q99NE5 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Rims1Q99NE5 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Rims1Q99NE5 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Rims1Q99NE5 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Rims1Q99NE5 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Rims1Q99NE5 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Rims1Q99NE5 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Rims1Q99NE5 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Rims1Q99NE5 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Rims1Q99NE5 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Rims1Q99NE5 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Rims1Q99NE5 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Rims1Q99NE5 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Rims1Q99NE5 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Rims1Q99NE5 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
Rims1Q99NE5 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Rims1Q99NE5 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Rims1Q99NE5 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Rims1Q99NE5 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Rims1Q99NE5 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Rims1Q99NE5 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Rims1Q99NE5 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Rims1Q99NE5 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Rims1Q99NE5 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Rims1Q99NE5 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Rims1Q99NE5 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Rims1Q99NE5 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Rims1Q99NE5 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Rims1Q99NE5 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Rims1Q99NE5 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Rims1Q99NE5 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
Rims1Q99NE5 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Rims1Q99NE5 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Rims1Q99NE5 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Rims1Q99NE5 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Rims1Q99NE5 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Rims1Q99NE5 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
Rims1Q99NE5 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Rims1Q99NE5 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Rims1Q99NE5 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Rims1Q99NE5 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Rims1Q99NE5 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Rims1Q99NE5 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Rims1Q99NE5 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Rims1Q99NE5 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107.7 ms