Protein–RNA interactions for Protein: Q99NC0

Vgll1, Transcription cofactor vestigial-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vgll1Q99NC0 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vgll1Q99NC0 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vgll1Q99NC0 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vgll1Q99NC0 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vgll1Q99NC0 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vgll1Q99NC0 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vgll1Q99NC0 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vgll1Q99NC0 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vgll1Q99NC0 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vgll1Q99NC0 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vgll1Q99NC0 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vgll1Q99NC0 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vgll1Q99NC0 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vgll1Q99NC0 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vgll1Q99NC0 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vgll1Q99NC0 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vgll1Q99NC0 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Vgll1Q99NC0 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vgll1Q99NC0 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vgll1Q99NC0 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vgll1Q99NC0 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vgll1Q99NC0 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vgll1Q99NC0 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Vgll1Q99NC0 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vgll1Q99NC0 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vgll1Q99NC0 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vgll1Q99NC0 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vgll1Q99NC0 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vgll1Q99NC0 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vgll1Q99NC0 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vgll1Q99NC0 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vgll1Q99NC0 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vgll1Q99NC0 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vgll1Q99NC0 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vgll1Q99NC0 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vgll1Q99NC0 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vgll1Q99NC0 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vgll1Q99NC0 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vgll1Q99NC0 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Vgll1Q99NC0 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Vgll1Q99NC0 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Vgll1Q99NC0 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vgll1Q99NC0 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vgll1Q99NC0 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vgll1Q99NC0 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vgll1Q99NC0 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Vgll1Q99NC0 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vgll1Q99NC0 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vgll1Q99NC0 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vgll1Q99NC0 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vgll1Q99NC0 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vgll1Q99NC0 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vgll1Q99NC0 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vgll1Q99NC0 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vgll1Q99NC0 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vgll1Q99NC0 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vgll1Q99NC0 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vgll1Q99NC0 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Vgll1Q99NC0 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vgll1Q99NC0 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vgll1Q99NC0 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vgll1Q99NC0 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vgll1Q99NC0 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vgll1Q99NC0 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vgll1Q99NC0 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vgll1Q99NC0 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vgll1Q99NC0 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vgll1Q99NC0 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Vgll1Q99NC0 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vgll1Q99NC0 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vgll1Q99NC0 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vgll1Q99NC0 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vgll1Q99NC0 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vgll1Q99NC0 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vgll1Q99NC0 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vgll1Q99NC0 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vgll1Q99NC0 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vgll1Q99NC0 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vgll1Q99NC0 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Vgll1Q99NC0 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vgll1Q99NC0 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vgll1Q99NC0 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vgll1Q99NC0 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vgll1Q99NC0 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vgll1Q99NC0 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vgll1Q99NC0 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Vgll1Q99NC0 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vgll1Q99NC0 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vgll1Q99NC0 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vgll1Q99NC0 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vgll1Q99NC0 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vgll1Q99NC0 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vgll1Q99NC0 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vgll1Q99NC0 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Vgll1Q99NC0 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vgll1Q99NC0 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vgll1Q99NC0 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vgll1Q99NC0 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vgll1Q99NC0 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vgll1Q99NC0 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms