Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV1

Tdrd1, Tudor domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd1Q99MV1 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tdrd1Q99MV1 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tdrd1Q99MV1 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Tdrd1Q99MV1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tdrd1Q99MV1 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Tdrd1Q99MV1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tdrd1Q99MV1 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Tdrd1Q99MV1 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tdrd1Q99MV1 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Tdrd1Q99MV1 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tdrd1Q99MV1 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Tdrd1Q99MV1 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tdrd1Q99MV1 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tdrd1Q99MV1 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tdrd1Q99MV1 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tdrd1Q99MV1 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tdrd1Q99MV1 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tdrd1Q99MV1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tdrd1Q99MV1 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tdrd1Q99MV1 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tdrd1Q99MV1 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tdrd1Q99MV1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tdrd1Q99MV1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tdrd1Q99MV1 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tdrd1Q99MV1 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Tdrd1Q99MV1 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Tdrd1Q99MV1 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tdrd1Q99MV1 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tdrd1Q99MV1 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tdrd1Q99MV1 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tdrd1Q99MV1 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tdrd1Q99MV1 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tdrd1Q99MV1 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tdrd1Q99MV1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tdrd1Q99MV1 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tdrd1Q99MV1 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Tdrd1Q99MV1 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tdrd1Q99MV1 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tdrd1Q99MV1 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tdrd1Q99MV1 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Tdrd1Q99MV1 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tdrd1Q99MV1 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tdrd1Q99MV1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tdrd1Q99MV1 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tdrd1Q99MV1 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tdrd1Q99MV1 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Tdrd1Q99MV1 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tdrd1Q99MV1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tdrd1Q99MV1 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tdrd1Q99MV1 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tdrd1Q99MV1 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tdrd1Q99MV1 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tdrd1Q99MV1 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tdrd1Q99MV1 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tdrd1Q99MV1 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tdrd1Q99MV1 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tdrd1Q99MV1 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tdrd1Q99MV1 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Tdrd1Q99MV1 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tdrd1Q99MV1 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tdrd1Q99MV1 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tdrd1Q99MV1 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tdrd1Q99MV1 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tdrd1Q99MV1 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tdrd1Q99MV1 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tdrd1Q99MV1 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tdrd1Q99MV1 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tdrd1Q99MV1 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tdrd1Q99MV1 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Tdrd1Q99MV1 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Tdrd1Q99MV1 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Tdrd1Q99MV1 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tdrd1Q99MV1 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tdrd1Q99MV1 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tdrd1Q99MV1 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tdrd1Q99MV1 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tdrd1Q99MV1 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tdrd1Q99MV1 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tdrd1Q99MV1 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tdrd1Q99MV1 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tdrd1Q99MV1 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tdrd1Q99MV1 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tdrd1Q99MV1 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tdrd1Q99MV1 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tdrd1Q99MV1 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tdrd1Q99MV1 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tdrd1Q99MV1 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tdrd1Q99MV1 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tdrd1Q99MV1 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tdrd1Q99MV1 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tdrd1Q99MV1 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tdrd1Q99MV1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tdrd1Q99MV1 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tdrd1Q99MV1 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Tdrd1Q99MV1 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tdrd1Q99MV1 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tdrd1Q99MV1 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tdrd1Q99MV1 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tdrd1Q99MV1 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tdrd1Q99MV1 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms