Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME3

Sncaip, Synphilin-1, mousemouse

Predictions only

Length 962 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SncaipQ99ME3 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SncaipQ99ME3 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SncaipQ99ME3 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SncaipQ99ME3 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SncaipQ99ME3 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SncaipQ99ME3 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SncaipQ99ME3 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SncaipQ99ME3 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SncaipQ99ME3 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SncaipQ99ME3 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SncaipQ99ME3 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SncaipQ99ME3 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SncaipQ99ME3 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SncaipQ99ME3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SncaipQ99ME3 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SncaipQ99ME3 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SncaipQ99ME3 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SncaipQ99ME3 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SncaipQ99ME3 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SncaipQ99ME3 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SncaipQ99ME3 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SncaipQ99ME3 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SncaipQ99ME3 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SncaipQ99ME3 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SncaipQ99ME3 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SncaipQ99ME3 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SncaipQ99ME3 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
SncaipQ99ME3 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SncaipQ99ME3 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SncaipQ99ME3 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SncaipQ99ME3 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SncaipQ99ME3 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SncaipQ99ME3 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SncaipQ99ME3 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SncaipQ99ME3 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SncaipQ99ME3 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SncaipQ99ME3 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SncaipQ99ME3 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SncaipQ99ME3 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SncaipQ99ME3 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SncaipQ99ME3 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SncaipQ99ME3 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SncaipQ99ME3 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SncaipQ99ME3 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SncaipQ99ME3 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SncaipQ99ME3 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SncaipQ99ME3 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SncaipQ99ME3 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SncaipQ99ME3 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SncaipQ99ME3 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SncaipQ99ME3 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SncaipQ99ME3 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SncaipQ99ME3 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SncaipQ99ME3 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SncaipQ99ME3 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SncaipQ99ME3 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SncaipQ99ME3 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SncaipQ99ME3 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SncaipQ99ME3 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SncaipQ99ME3 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SncaipQ99ME3 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SncaipQ99ME3 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SncaipQ99ME3 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SncaipQ99ME3 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SncaipQ99ME3 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SncaipQ99ME3 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SncaipQ99ME3 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SncaipQ99ME3 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SncaipQ99ME3 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SncaipQ99ME3 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SncaipQ99ME3 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SncaipQ99ME3 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SncaipQ99ME3 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SncaipQ99ME3 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SncaipQ99ME3 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SncaipQ99ME3 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SncaipQ99ME3 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SncaipQ99ME3 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SncaipQ99ME3 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SncaipQ99ME3 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SncaipQ99ME3 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SncaipQ99ME3 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SncaipQ99ME3 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SncaipQ99ME3 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SncaipQ99ME3 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SncaipQ99ME3 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SncaipQ99ME3 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SncaipQ99ME3 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SncaipQ99ME3 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SncaipQ99ME3 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SncaipQ99ME3 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SncaipQ99ME3 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SncaipQ99ME3 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SncaipQ99ME3 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SncaipQ99ME3 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SncaipQ99ME3 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SncaipQ99ME3 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SncaipQ99ME3 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SncaipQ99ME3 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SncaipQ99ME3 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.4 ms