Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
PtprtQ99M80 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
PtprtQ99M80 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC32.93■■■□□ 2.86
PtprtQ99M80 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
PtprtQ99M80 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
PtprtQ99M80 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
PtprtQ99M80 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
PtprtQ99M80 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
PtprtQ99M80 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
PtprtQ99M80 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
PtprtQ99M80 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
PtprtQ99M80 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
PtprtQ99M80 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
PtprtQ99M80 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
PtprtQ99M80 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
PtprtQ99M80 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
PtprtQ99M80 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
PtprtQ99M80 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
PtprtQ99M80 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
PtprtQ99M80 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
PtprtQ99M80 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
PtprtQ99M80 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
PtprtQ99M80 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
PtprtQ99M80 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
PtprtQ99M80 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
PtprtQ99M80 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
PtprtQ99M80 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
PtprtQ99M80 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC32.87■■■□□ 2.85
PtprtQ99M80 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
PtprtQ99M80 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
PtprtQ99M80 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
PtprtQ99M80 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
PtprtQ99M80 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC32.86■■■□□ 2.85
PtprtQ99M80 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC32.86■■■□□ 2.85
PtprtQ99M80 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC32.86■■■□□ 2.85
PtprtQ99M80 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
PtprtQ99M80 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
PtprtQ99M80 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
PtprtQ99M80 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
PtprtQ99M80 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
PtprtQ99M80 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC32.86■■■□□ 2.85
PtprtQ99M80 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
PtprtQ99M80 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
PtprtQ99M80 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
PtprtQ99M80 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
PtprtQ99M80 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC32.84■■■□□ 2.85
PtprtQ99M80 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
PtprtQ99M80 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
PtprtQ99M80 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
PtprtQ99M80 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC32.82■■■□□ 2.84
PtprtQ99M80 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC32.82■■■□□ 2.84
PtprtQ99M80 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC32.82■■■□□ 2.84
PtprtQ99M80 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC32.81■■■□□ 2.84
PtprtQ99M80 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
PtprtQ99M80 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
PtprtQ99M80 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
PtprtQ99M80 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
PtprtQ99M80 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
PtprtQ99M80 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
PtprtQ99M80 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
PtprtQ99M80 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
PtprtQ99M80 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
PtprtQ99M80 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
PtprtQ99M80 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
PtprtQ99M80 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
PtprtQ99M80 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
PtprtQ99M80 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
PtprtQ99M80 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
PtprtQ99M80 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
PtprtQ99M80 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
PtprtQ99M80 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
PtprtQ99M80 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
PtprtQ99M80 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
PtprtQ99M80 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
PtprtQ99M80 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
PtprtQ99M80 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
PtprtQ99M80 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC32.74■■■□□ 2.83
PtprtQ99M80 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
PtprtQ99M80 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
PtprtQ99M80 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
PtprtQ99M80 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
PtprtQ99M80 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
PtprtQ99M80 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
PtprtQ99M80 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
PtprtQ99M80 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
PtprtQ99M80 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
PtprtQ99M80 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
PtprtQ99M80 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
PtprtQ99M80 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
PtprtQ99M80 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC32.7■■■□□ 2.83
PtprtQ99M80 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC32.69■■■□□ 2.82
PtprtQ99M80 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC32.69■■■□□ 2.82
PtprtQ99M80 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
PtprtQ99M80 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
PtprtQ99M80 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
PtprtQ99M80 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC32.68■■■□□ 2.82
PtprtQ99M80 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
PtprtQ99M80 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
PtprtQ99M80 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
PtprtQ99M80 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
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