Protein–RNA interactions for Protein: Q99KJ0

Ubxn2a, UBX domain-containing protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2aQ99KJ0 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ubxn2aQ99KJ0 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ubxn2aQ99KJ0 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ubxn2aQ99KJ0 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ubxn2aQ99KJ0 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ubxn2aQ99KJ0 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ubxn2aQ99KJ0 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ubxn2aQ99KJ0 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ubxn2aQ99KJ0 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ubxn2aQ99KJ0 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ubxn2aQ99KJ0 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ubxn2aQ99KJ0 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ubxn2aQ99KJ0 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ubxn2aQ99KJ0 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ubxn2aQ99KJ0 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ubxn2aQ99KJ0 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ubxn2aQ99KJ0 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ubxn2aQ99KJ0 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ubxn2aQ99KJ0 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ubxn2aQ99KJ0 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ubxn2aQ99KJ0 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ubxn2aQ99KJ0 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ubxn2aQ99KJ0 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ubxn2aQ99KJ0 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ubxn2aQ99KJ0 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ubxn2aQ99KJ0 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ubxn2aQ99KJ0 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ubxn2aQ99KJ0 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ubxn2aQ99KJ0 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ubxn2aQ99KJ0 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ubxn2aQ99KJ0 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ubxn2aQ99KJ0 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ubxn2aQ99KJ0 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ubxn2aQ99KJ0 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ubxn2aQ99KJ0 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ubxn2aQ99KJ0 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Ubxn2aQ99KJ0 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ubxn2aQ99KJ0 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ubxn2aQ99KJ0 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ubxn2aQ99KJ0 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ubxn2aQ99KJ0 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ubxn2aQ99KJ0 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Ubxn2aQ99KJ0 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ubxn2aQ99KJ0 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ubxn2aQ99KJ0 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ubxn2aQ99KJ0 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ubxn2aQ99KJ0 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ubxn2aQ99KJ0 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ubxn2aQ99KJ0 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ubxn2aQ99KJ0 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ubxn2aQ99KJ0 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ubxn2aQ99KJ0 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ubxn2aQ99KJ0 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ubxn2aQ99KJ0 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ubxn2aQ99KJ0 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ubxn2aQ99KJ0 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ubxn2aQ99KJ0 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ubxn2aQ99KJ0 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ubxn2aQ99KJ0 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ubxn2aQ99KJ0 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Ubxn2aQ99KJ0 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ubxn2aQ99KJ0 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ubxn2aQ99KJ0 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ubxn2aQ99KJ0 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ubxn2aQ99KJ0 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Ubxn2aQ99KJ0 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ubxn2aQ99KJ0 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ubxn2aQ99KJ0 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ubxn2aQ99KJ0 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ubxn2aQ99KJ0 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ubxn2aQ99KJ0 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ubxn2aQ99KJ0 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ubxn2aQ99KJ0 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ubxn2aQ99KJ0 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ubxn2aQ99KJ0 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ubxn2aQ99KJ0 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ubxn2aQ99KJ0 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ubxn2aQ99KJ0 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ubxn2aQ99KJ0 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Ubxn2aQ99KJ0 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ubxn2aQ99KJ0 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ubxn2aQ99KJ0 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ubxn2aQ99KJ0 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ubxn2aQ99KJ0 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ubxn2aQ99KJ0 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ubxn2aQ99KJ0 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Ubxn2aQ99KJ0 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ubxn2aQ99KJ0 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ubxn2aQ99KJ0 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ubxn2aQ99KJ0 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Ubxn2aQ99KJ0 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ubxn2aQ99KJ0 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ubxn2aQ99KJ0 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ubxn2aQ99KJ0 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ubxn2aQ99KJ0 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ubxn2aQ99KJ0 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ubxn2aQ99KJ0 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Ubxn2aQ99KJ0 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ubxn2aQ99KJ0 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ubxn2aQ99KJ0 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms