Protein–RNA interactions for Protein: Q99KF1

Tmed9, Transmembrane emp24 domain-containing protein 9, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed9Q99KF1 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tmed9Q99KF1 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tmed9Q99KF1 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Tmed9Q99KF1 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tmed9Q99KF1 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tmed9Q99KF1 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tmed9Q99KF1 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tmed9Q99KF1 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tmed9Q99KF1 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Tmed9Q99KF1 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tmed9Q99KF1 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tmed9Q99KF1 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tmed9Q99KF1 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tmed9Q99KF1 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Tmed9Q99KF1 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tmed9Q99KF1 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tmed9Q99KF1 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tmed9Q99KF1 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tmed9Q99KF1 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tmed9Q99KF1 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Tmed9Q99KF1 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tmed9Q99KF1 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tmed9Q99KF1 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tmed9Q99KF1 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tmed9Q99KF1 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tmed9Q99KF1 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tmed9Q99KF1 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tmed9Q99KF1 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tmed9Q99KF1 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tmed9Q99KF1 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tmed9Q99KF1 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tmed9Q99KF1 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tmed9Q99KF1 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tmed9Q99KF1 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Tmed9Q99KF1 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tmed9Q99KF1 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tmed9Q99KF1 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tmed9Q99KF1 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tmed9Q99KF1 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tmed9Q99KF1 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tmed9Q99KF1 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tmed9Q99KF1 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tmed9Q99KF1 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tmed9Q99KF1 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tmed9Q99KF1 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tmed9Q99KF1 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tmed9Q99KF1 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tmed9Q99KF1 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tmed9Q99KF1 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tmed9Q99KF1 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tmed9Q99KF1 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tmed9Q99KF1 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tmed9Q99KF1 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tmed9Q99KF1 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tmed9Q99KF1 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Tmed9Q99KF1 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tmed9Q99KF1 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tmed9Q99KF1 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tmed9Q99KF1 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tmed9Q99KF1 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tmed9Q99KF1 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tmed9Q99KF1 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tmed9Q99KF1 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Tmed9Q99KF1 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tmed9Q99KF1 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tmed9Q99KF1 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tmed9Q99KF1 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Tmed9Q99KF1 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Tmed9Q99KF1 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tmed9Q99KF1 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tmed9Q99KF1 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tmed9Q99KF1 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tmed9Q99KF1 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tmed9Q99KF1 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tmed9Q99KF1 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tmed9Q99KF1 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tmed9Q99KF1 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tmed9Q99KF1 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tmed9Q99KF1 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Tmed9Q99KF1 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Tmed9Q99KF1 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tmed9Q99KF1 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tmed9Q99KF1 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tmed9Q99KF1 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tmed9Q99KF1 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tmed9Q99KF1 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tmed9Q99KF1 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tmed9Q99KF1 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tmed9Q99KF1 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tmed9Q99KF1 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Tmed9Q99KF1 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tmed9Q99KF1 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tmed9Q99KF1 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tmed9Q99KF1 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tmed9Q99KF1 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tmed9Q99KF1 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tmed9Q99KF1 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tmed9Q99KF1 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tmed9Q99KF1 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmed9Q99KF1 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
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