Protein–RNA interactions for Protein: Q99J27

Slc33a1, Acetyl-coenzyme A transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc33a1Q99J27 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc33a1Q99J27 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc33a1Q99J27 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc33a1Q99J27 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc33a1Q99J27 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc33a1Q99J27 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc33a1Q99J27 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Slc33a1Q99J27 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slc33a1Q99J27 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slc33a1Q99J27 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slc33a1Q99J27 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slc33a1Q99J27 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slc33a1Q99J27 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slc33a1Q99J27 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slc33a1Q99J27 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slc33a1Q99J27 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc33a1Q99J27 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc33a1Q99J27 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc33a1Q99J27 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc33a1Q99J27 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc33a1Q99J27 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc33a1Q99J27 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc33a1Q99J27 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc33a1Q99J27 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc33a1Q99J27 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc33a1Q99J27 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc33a1Q99J27 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc33a1Q99J27 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc33a1Q99J27 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc33a1Q99J27 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc33a1Q99J27 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc33a1Q99J27 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc33a1Q99J27 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc33a1Q99J27 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc33a1Q99J27 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc33a1Q99J27 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc33a1Q99J27 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc33a1Q99J27 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc33a1Q99J27 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc33a1Q99J27 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc33a1Q99J27 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc33a1Q99J27 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc33a1Q99J27 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc33a1Q99J27 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc33a1Q99J27 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc33a1Q99J27 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc33a1Q99J27 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc33a1Q99J27 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc33a1Q99J27 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc33a1Q99J27 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc33a1Q99J27 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc33a1Q99J27 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc33a1Q99J27 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc33a1Q99J27 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc33a1Q99J27 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc33a1Q99J27 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc33a1Q99J27 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc33a1Q99J27 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc33a1Q99J27 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc33a1Q99J27 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc33a1Q99J27 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc33a1Q99J27 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc33a1Q99J27 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc33a1Q99J27 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Slc33a1Q99J27 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Slc33a1Q99J27 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Slc33a1Q99J27 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Slc33a1Q99J27 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc33a1Q99J27 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc33a1Q99J27 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc33a1Q99J27 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc33a1Q99J27 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc33a1Q99J27 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc33a1Q99J27 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc33a1Q99J27 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc33a1Q99J27 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc33a1Q99J27 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc33a1Q99J27 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc33a1Q99J27 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc33a1Q99J27 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc33a1Q99J27 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc33a1Q99J27 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc33a1Q99J27 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc33a1Q99J27 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc33a1Q99J27 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc33a1Q99J27 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc33a1Q99J27 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc33a1Q99J27 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc33a1Q99J27 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc33a1Q99J27 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc33a1Q99J27 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc33a1Q99J27 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc33a1Q99J27 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc33a1Q99J27 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc33a1Q99J27 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc33a1Q99J27 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc33a1Q99J27 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc33a1Q99J27 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc33a1Q99J27 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc33a1Q99J27 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms