Protein–RNA interactions for Protein: Q925I1

Atad3, ATPase family AAA domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atad3Q925I1 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atad3Q925I1 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atad3Q925I1 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atad3Q925I1 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Atad3Q925I1 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atad3Q925I1 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atad3Q925I1 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atad3Q925I1 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atad3Q925I1 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atad3Q925I1 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atad3Q925I1 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atad3Q925I1 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atad3Q925I1 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atad3Q925I1 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Atad3Q925I1 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Atad3Q925I1 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atad3Q925I1 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atad3Q925I1 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atad3Q925I1 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atad3Q925I1 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atad3Q925I1 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atad3Q925I1 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atad3Q925I1 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atad3Q925I1 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atad3Q925I1 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atad3Q925I1 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atad3Q925I1 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atad3Q925I1 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atad3Q925I1 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atad3Q925I1 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atad3Q925I1 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atad3Q925I1 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atad3Q925I1 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atad3Q925I1 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atad3Q925I1 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atad3Q925I1 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atad3Q925I1 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atad3Q925I1 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atad3Q925I1 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atad3Q925I1 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atad3Q925I1 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atad3Q925I1 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Atad3Q925I1 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atad3Q925I1 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atad3Q925I1 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atad3Q925I1 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atad3Q925I1 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atad3Q925I1 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atad3Q925I1 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atad3Q925I1 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atad3Q925I1 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atad3Q925I1 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atad3Q925I1 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atad3Q925I1 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atad3Q925I1 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atad3Q925I1 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atad3Q925I1 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atad3Q925I1 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atad3Q925I1 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atad3Q925I1 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atad3Q925I1 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atad3Q925I1 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atad3Q925I1 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atad3Q925I1 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atad3Q925I1 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Atad3Q925I1 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atad3Q925I1 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atad3Q925I1 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atad3Q925I1 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atad3Q925I1 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atad3Q925I1 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Atad3Q925I1 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atad3Q925I1 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Atad3Q925I1 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atad3Q925I1 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atad3Q925I1 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atad3Q925I1 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atad3Q925I1 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atad3Q925I1 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Atad3Q925I1 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atad3Q925I1 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atad3Q925I1 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atad3Q925I1 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atad3Q925I1 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atad3Q925I1 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atad3Q925I1 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Atad3Q925I1 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atad3Q925I1 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Atad3Q925I1 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atad3Q925I1 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atad3Q925I1 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atad3Q925I1 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Atad3Q925I1 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atad3Q925I1 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atad3Q925I1 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atad3Q925I1 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atad3Q925I1 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atad3Q925I1 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Atad3Q925I1 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Atad3Q925I1 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms