Protein–RNA interactions for Protein: Q921M3

Sf3b3, Splicing factor 3B subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b3Q921M3 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Sf3b3Q921M3 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sf3b3Q921M3 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sf3b3Q921M3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sf3b3Q921M3 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sf3b3Q921M3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sf3b3Q921M3 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Sf3b3Q921M3 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Sf3b3Q921M3 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Sf3b3Q921M3 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Sf3b3Q921M3 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Sf3b3Q921M3 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Sf3b3Q921M3 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Sf3b3Q921M3 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Sf3b3Q921M3 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Sf3b3Q921M3 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Sf3b3Q921M3 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Sf3b3Q921M3 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Sf3b3Q921M3 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Sf3b3Q921M3 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Sf3b3Q921M3 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Sf3b3Q921M3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sf3b3Q921M3 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sf3b3Q921M3 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sf3b3Q921M3 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sf3b3Q921M3 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Sf3b3Q921M3 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Sf3b3Q921M3 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Sf3b3Q921M3 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Sf3b3Q921M3 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Sf3b3Q921M3 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Sf3b3Q921M3 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Sf3b3Q921M3 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Sf3b3Q921M3 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Sf3b3Q921M3 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Sf3b3Q921M3 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Sf3b3Q921M3 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Sf3b3Q921M3 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Sf3b3Q921M3 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Sf3b3Q921M3 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Sf3b3Q921M3 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Sf3b3Q921M3 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Sf3b3Q921M3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Sf3b3Q921M3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Sf3b3Q921M3 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Sf3b3Q921M3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Sf3b3Q921M3 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Sf3b3Q921M3 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Sf3b3Q921M3 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Sf3b3Q921M3 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Sf3b3Q921M3 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Sf3b3Q921M3 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Sf3b3Q921M3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Sf3b3Q921M3 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Sf3b3Q921M3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Sf3b3Q921M3 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Sf3b3Q921M3 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Sf3b3Q921M3 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Sf3b3Q921M3 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Sf3b3Q921M3 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Sf3b3Q921M3 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Sf3b3Q921M3 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Sf3b3Q921M3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sf3b3Q921M3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sf3b3Q921M3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sf3b3Q921M3 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Sf3b3Q921M3 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Sf3b3Q921M3 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Sf3b3Q921M3 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Sf3b3Q921M3 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Sf3b3Q921M3 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sf3b3Q921M3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sf3b3Q921M3 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sf3b3Q921M3 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sf3b3Q921M3 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sf3b3Q921M3 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sf3b3Q921M3 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sf3b3Q921M3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sf3b3Q921M3 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sf3b3Q921M3 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Sf3b3Q921M3 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Sf3b3Q921M3 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Sf3b3Q921M3 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Sf3b3Q921M3 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Sf3b3Q921M3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Sf3b3Q921M3 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Sf3b3Q921M3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Sf3b3Q921M3 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Sf3b3Q921M3 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Sf3b3Q921M3 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Sf3b3Q921M3 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Sf3b3Q921M3 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sf3b3Q921M3 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sf3b3Q921M3 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sf3b3Q921M3 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sf3b3Q921M3 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sf3b3Q921M3 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sf3b3Q921M3 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sf3b3Q921M3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Sf3b3Q921M3 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms