Protein–RNA interactions for Protein: Q920D3

Med28, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med28Q920D3 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Med28Q920D3 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Med28Q920D3 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Med28Q920D3 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Med28Q920D3 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Med28Q920D3 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Med28Q920D3 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Med28Q920D3 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Med28Q920D3 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Med28Q920D3 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Med28Q920D3 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Med28Q920D3 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Med28Q920D3 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Med28Q920D3 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Med28Q920D3 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Med28Q920D3 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Med28Q920D3 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Med28Q920D3 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Med28Q920D3 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Med28Q920D3 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Med28Q920D3 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Med28Q920D3 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Med28Q920D3 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Med28Q920D3 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Med28Q920D3 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Med28Q920D3 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Med28Q920D3 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Med28Q920D3 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Med28Q920D3 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Med28Q920D3 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Med28Q920D3 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Med28Q920D3 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Med28Q920D3 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Med28Q920D3 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Med28Q920D3 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Med28Q920D3 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Med28Q920D3 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Med28Q920D3 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Med28Q920D3 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Med28Q920D3 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Med28Q920D3 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Med28Q920D3 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Med28Q920D3 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Med28Q920D3 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Med28Q920D3 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Med28Q920D3 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Med28Q920D3 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Med28Q920D3 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Med28Q920D3 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Med28Q920D3 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Med28Q920D3 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Med28Q920D3 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Med28Q920D3 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Med28Q920D3 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Med28Q920D3 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Med28Q920D3 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Med28Q920D3 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Med28Q920D3 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Med28Q920D3 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Med28Q920D3 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Med28Q920D3 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Med28Q920D3 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Med28Q920D3 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Med28Q920D3 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Med28Q920D3 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Med28Q920D3 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Med28Q920D3 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Med28Q920D3 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Med28Q920D3 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Med28Q920D3 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Med28Q920D3 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Med28Q920D3 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Med28Q920D3 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Med28Q920D3 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Med28Q920D3 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Med28Q920D3 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Med28Q920D3 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Med28Q920D3 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Med28Q920D3 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Med28Q920D3 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Med28Q920D3 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Med28Q920D3 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Med28Q920D3 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Med28Q920D3 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Med28Q920D3 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Med28Q920D3 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Med28Q920D3 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Med28Q920D3 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Med28Q920D3 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Med28Q920D3 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Med28Q920D3 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Med28Q920D3 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Med28Q920D3 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Med28Q920D3 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Med28Q920D3 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Med28Q920D3 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Med28Q920D3 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Med28Q920D3 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Med28Q920D3 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Med28Q920D3 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms