Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZW3

Smarca5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca5Q91ZW3 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Smarca5Q91ZW3 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Smarca5Q91ZW3 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Smarca5Q91ZW3 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Smarca5Q91ZW3 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Smarca5Q91ZW3 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Smarca5Q91ZW3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Smarca5Q91ZW3 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Smarca5Q91ZW3 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Smarca5Q91ZW3 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Smarca5Q91ZW3 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Smarca5Q91ZW3 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Smarca5Q91ZW3 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Smarca5Q91ZW3 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Smarca5Q91ZW3 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Smarca5Q91ZW3 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Smarca5Q91ZW3 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Smarca5Q91ZW3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Smarca5Q91ZW3 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Smarca5Q91ZW3 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Smarca5Q91ZW3 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Smarca5Q91ZW3 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Smarca5Q91ZW3 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Smarca5Q91ZW3 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Smarca5Q91ZW3 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Smarca5Q91ZW3 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Smarca5Q91ZW3 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Smarca5Q91ZW3 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Smarca5Q91ZW3 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Smarca5Q91ZW3 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Smarca5Q91ZW3 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Smarca5Q91ZW3 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Smarca5Q91ZW3 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Smarca5Q91ZW3 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Smarca5Q91ZW3 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Smarca5Q91ZW3 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Smarca5Q91ZW3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Smarca5Q91ZW3 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Smarca5Q91ZW3 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Smarca5Q91ZW3 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Smarca5Q91ZW3 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Smarca5Q91ZW3 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Smarca5Q91ZW3 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Smarca5Q91ZW3 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Smarca5Q91ZW3 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Smarca5Q91ZW3 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Smarca5Q91ZW3 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Smarca5Q91ZW3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Smarca5Q91ZW3 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Smarca5Q91ZW3 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Smarca5Q91ZW3 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Smarca5Q91ZW3 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Smarca5Q91ZW3 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Smarca5Q91ZW3 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Smarca5Q91ZW3 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Smarca5Q91ZW3 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Smarca5Q91ZW3 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Smarca5Q91ZW3 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Smarca5Q91ZW3 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Smarca5Q91ZW3 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Smarca5Q91ZW3 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Smarca5Q91ZW3 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Smarca5Q91ZW3 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
Smarca5Q91ZW3 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Smarca5Q91ZW3 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Smarca5Q91ZW3 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Smarca5Q91ZW3 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Smarca5Q91ZW3 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Smarca5Q91ZW3 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Smarca5Q91ZW3 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Smarca5Q91ZW3 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Smarca5Q91ZW3 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Smarca5Q91ZW3 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Smarca5Q91ZW3 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Smarca5Q91ZW3 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Smarca5Q91ZW3 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Smarca5Q91ZW3 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Smarca5Q91ZW3 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Smarca5Q91ZW3 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Smarca5Q91ZW3 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Smarca5Q91ZW3 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Smarca5Q91ZW3 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Smarca5Q91ZW3 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Smarca5Q91ZW3 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Smarca5Q91ZW3 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Smarca5Q91ZW3 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Smarca5Q91ZW3 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Smarca5Q91ZW3 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Smarca5Q91ZW3 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Smarca5Q91ZW3 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Smarca5Q91ZW3 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Smarca5Q91ZW3 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Smarca5Q91ZW3 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Smarca5Q91ZW3 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Smarca5Q91ZW3 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Smarca5Q91ZW3 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Smarca5Q91ZW3 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Smarca5Q91ZW3 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Smarca5Q91ZW3 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Smarca5Q91ZW3 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms