Protein–RNA interactions for Protein: Q8VED5

Krt79, Keratin, type II cytoskeletal 79, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt79Q8VED5 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Krt79Q8VED5 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Krt79Q8VED5 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Krt79Q8VED5 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Krt79Q8VED5 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Krt79Q8VED5 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Krt79Q8VED5 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Krt79Q8VED5 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Krt79Q8VED5 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Krt79Q8VED5 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Krt79Q8VED5 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Krt79Q8VED5 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Krt79Q8VED5 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Krt79Q8VED5 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Krt79Q8VED5 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Krt79Q8VED5 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Krt79Q8VED5 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Krt79Q8VED5 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Krt79Q8VED5 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Krt79Q8VED5 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Krt79Q8VED5 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Krt79Q8VED5 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Krt79Q8VED5 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Krt79Q8VED5 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Krt79Q8VED5 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Krt79Q8VED5 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Krt79Q8VED5 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Krt79Q8VED5 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Krt79Q8VED5 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Krt79Q8VED5 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Krt79Q8VED5 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Krt79Q8VED5 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Krt79Q8VED5 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Krt79Q8VED5 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Krt79Q8VED5 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Krt79Q8VED5 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Krt79Q8VED5 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Krt79Q8VED5 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Krt79Q8VED5 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Krt79Q8VED5 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Krt79Q8VED5 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Krt79Q8VED5 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Krt79Q8VED5 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Krt79Q8VED5 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Krt79Q8VED5 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Krt79Q8VED5 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Krt79Q8VED5 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Krt79Q8VED5 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Krt79Q8VED5 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Krt79Q8VED5 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Krt79Q8VED5 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Krt79Q8VED5 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Krt79Q8VED5 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Krt79Q8VED5 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Krt79Q8VED5 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Krt79Q8VED5 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Krt79Q8VED5 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Krt79Q8VED5 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Krt79Q8VED5 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Krt79Q8VED5 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Krt79Q8VED5 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Krt79Q8VED5 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Krt79Q8VED5 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Krt79Q8VED5 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Krt79Q8VED5 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Krt79Q8VED5 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Krt79Q8VED5 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Krt79Q8VED5 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Krt79Q8VED5 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Krt79Q8VED5 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Krt79Q8VED5 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Krt79Q8VED5 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Krt79Q8VED5 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Krt79Q8VED5 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Krt79Q8VED5 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Krt79Q8VED5 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Krt79Q8VED5 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Krt79Q8VED5 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Krt79Q8VED5 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Krt79Q8VED5 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Krt79Q8VED5 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Krt79Q8VED5 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Krt79Q8VED5 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Krt79Q8VED5 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Krt79Q8VED5 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Krt79Q8VED5 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Krt79Q8VED5 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Krt79Q8VED5 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Krt79Q8VED5 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Krt79Q8VED5 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Krt79Q8VED5 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Krt79Q8VED5 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Krt79Q8VED5 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Krt79Q8VED5 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Krt79Q8VED5 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Krt79Q8VED5 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Krt79Q8VED5 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Krt79Q8VED5 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Krt79Q8VED5 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Krt79Q8VED5 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms