Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDU5

Snrk, SNF-related serine/threonine-protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 748 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrkQ8VDU5 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SnrkQ8VDU5 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SnrkQ8VDU5 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SnrkQ8VDU5 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SnrkQ8VDU5 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SnrkQ8VDU5 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SnrkQ8VDU5 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SnrkQ8VDU5 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SnrkQ8VDU5 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SnrkQ8VDU5 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SnrkQ8VDU5 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SnrkQ8VDU5 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SnrkQ8VDU5 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SnrkQ8VDU5 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SnrkQ8VDU5 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
SnrkQ8VDU5 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SnrkQ8VDU5 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SnrkQ8VDU5 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SnrkQ8VDU5 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SnrkQ8VDU5 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SnrkQ8VDU5 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SnrkQ8VDU5 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SnrkQ8VDU5 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SnrkQ8VDU5 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SnrkQ8VDU5 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SnrkQ8VDU5 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SnrkQ8VDU5 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SnrkQ8VDU5 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SnrkQ8VDU5 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SnrkQ8VDU5 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SnrkQ8VDU5 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SnrkQ8VDU5 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SnrkQ8VDU5 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SnrkQ8VDU5 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SnrkQ8VDU5 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SnrkQ8VDU5 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
SnrkQ8VDU5 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SnrkQ8VDU5 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SnrkQ8VDU5 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SnrkQ8VDU5 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SnrkQ8VDU5 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SnrkQ8VDU5 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SnrkQ8VDU5 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SnrkQ8VDU5 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SnrkQ8VDU5 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SnrkQ8VDU5 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
SnrkQ8VDU5 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SnrkQ8VDU5 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SnrkQ8VDU5 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SnrkQ8VDU5 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SnrkQ8VDU5 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SnrkQ8VDU5 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SnrkQ8VDU5 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SnrkQ8VDU5 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SnrkQ8VDU5 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SnrkQ8VDU5 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SnrkQ8VDU5 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SnrkQ8VDU5 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SnrkQ8VDU5 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SnrkQ8VDU5 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SnrkQ8VDU5 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SnrkQ8VDU5 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
SnrkQ8VDU5 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SnrkQ8VDU5 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SnrkQ8VDU5 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SnrkQ8VDU5 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SnrkQ8VDU5 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SnrkQ8VDU5 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SnrkQ8VDU5 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SnrkQ8VDU5 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SnrkQ8VDU5 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SnrkQ8VDU5 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
SnrkQ8VDU5 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SnrkQ8VDU5 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SnrkQ8VDU5 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SnrkQ8VDU5 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
SnrkQ8VDU5 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SnrkQ8VDU5 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SnrkQ8VDU5 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SnrkQ8VDU5 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SnrkQ8VDU5 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SnrkQ8VDU5 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SnrkQ8VDU5 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SnrkQ8VDU5 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SnrkQ8VDU5 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SnrkQ8VDU5 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SnrkQ8VDU5 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SnrkQ8VDU5 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SnrkQ8VDU5 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SnrkQ8VDU5 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SnrkQ8VDU5 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SnrkQ8VDU5 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SnrkQ8VDU5 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SnrkQ8VDU5 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SnrkQ8VDU5 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SnrkQ8VDU5 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
SnrkQ8VDU5 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SnrkQ8VDU5 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SnrkQ8VDU5 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SnrkQ8VDU5 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms