Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCE1

Dnajc28, DnaJ homolog subfamily C member 28, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc28Q8VCE1 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Dnajc28Q8VCE1 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Dnajc28Q8VCE1 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Dnajc28Q8VCE1 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Dnajc28Q8VCE1 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Dnajc28Q8VCE1 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Dnajc28Q8VCE1 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Dnajc28Q8VCE1 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Dnajc28Q8VCE1 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Dnajc28Q8VCE1 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Dnajc28Q8VCE1 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dnajc28Q8VCE1 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dnajc28Q8VCE1 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dnajc28Q8VCE1 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dnajc28Q8VCE1 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dnajc28Q8VCE1 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dnajc28Q8VCE1 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dnajc28Q8VCE1 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dnajc28Q8VCE1 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dnajc28Q8VCE1 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dnajc28Q8VCE1 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Dnajc28Q8VCE1 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Dnajc28Q8VCE1 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Dnajc28Q8VCE1 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Dnajc28Q8VCE1 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Dnajc28Q8VCE1 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Dnajc28Q8VCE1 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Dnajc28Q8VCE1 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dnajc28Q8VCE1 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dnajc28Q8VCE1 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dnajc28Q8VCE1 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dnajc28Q8VCE1 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dnajc28Q8VCE1 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dnajc28Q8VCE1 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Dnajc28Q8VCE1 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dnajc28Q8VCE1 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dnajc28Q8VCE1 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dnajc28Q8VCE1 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dnajc28Q8VCE1 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dnajc28Q8VCE1 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dnajc28Q8VCE1 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Dnajc28Q8VCE1 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Dnajc28Q8VCE1 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Dnajc28Q8VCE1 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Dnajc28Q8VCE1 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Dnajc28Q8VCE1 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Dnajc28Q8VCE1 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Dnajc28Q8VCE1 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Dnajc28Q8VCE1 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Dnajc28Q8VCE1 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Dnajc28Q8VCE1 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Dnajc28Q8VCE1 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Dnajc28Q8VCE1 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Dnajc28Q8VCE1 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Dnajc28Q8VCE1 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Dnajc28Q8VCE1 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Dnajc28Q8VCE1 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Dnajc28Q8VCE1 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dnajc28Q8VCE1 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Dnajc28Q8VCE1 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dnajc28Q8VCE1 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dnajc28Q8VCE1 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dnajc28Q8VCE1 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dnajc28Q8VCE1 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dnajc28Q8VCE1 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dnajc28Q8VCE1 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dnajc28Q8VCE1 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dnajc28Q8VCE1 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dnajc28Q8VCE1 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dnajc28Q8VCE1 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dnajc28Q8VCE1 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dnajc28Q8VCE1 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dnajc28Q8VCE1 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Dnajc28Q8VCE1 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Dnajc28Q8VCE1 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dnajc28Q8VCE1 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Dnajc28Q8VCE1 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dnajc28Q8VCE1 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dnajc28Q8VCE1 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dnajc28Q8VCE1 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dnajc28Q8VCE1 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Dnajc28Q8VCE1 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Dnajc28Q8VCE1 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Dnajc28Q8VCE1 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Dnajc28Q8VCE1 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Dnajc28Q8VCE1 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Dnajc28Q8VCE1 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dnajc28Q8VCE1 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dnajc28Q8VCE1 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dnajc28Q8VCE1 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dnajc28Q8VCE1 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dnajc28Q8VCE1 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dnajc28Q8VCE1 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dnajc28Q8VCE1 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dnajc28Q8VCE1 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dnajc28Q8VCE1 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dnajc28Q8VCE1 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Dnajc28Q8VCE1 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Dnajc28Q8VCE1 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Dnajc28Q8VCE1 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms