Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3I4

Myrip, Rab effector MyRIP, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MyripQ8K3I4 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MyripQ8K3I4 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MyripQ8K3I4 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MyripQ8K3I4 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MyripQ8K3I4 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MyripQ8K3I4 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MyripQ8K3I4 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MyripQ8K3I4 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MyripQ8K3I4 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MyripQ8K3I4 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MyripQ8K3I4 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MyripQ8K3I4 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MyripQ8K3I4 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MyripQ8K3I4 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MyripQ8K3I4 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MyripQ8K3I4 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MyripQ8K3I4 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MyripQ8K3I4 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MyripQ8K3I4 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MyripQ8K3I4 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
MyripQ8K3I4 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MyripQ8K3I4 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MyripQ8K3I4 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MyripQ8K3I4 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MyripQ8K3I4 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MyripQ8K3I4 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
MyripQ8K3I4 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MyripQ8K3I4 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MyripQ8K3I4 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
MyripQ8K3I4 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MyripQ8K3I4 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MyripQ8K3I4 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MyripQ8K3I4 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MyripQ8K3I4 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MyripQ8K3I4 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MyripQ8K3I4 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MyripQ8K3I4 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MyripQ8K3I4 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MyripQ8K3I4 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MyripQ8K3I4 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MyripQ8K3I4 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
MyripQ8K3I4 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MyripQ8K3I4 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
MyripQ8K3I4 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MyripQ8K3I4 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MyripQ8K3I4 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MyripQ8K3I4 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MyripQ8K3I4 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MyripQ8K3I4 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MyripQ8K3I4 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MyripQ8K3I4 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MyripQ8K3I4 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MyripQ8K3I4 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MyripQ8K3I4 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
MyripQ8K3I4 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MyripQ8K3I4 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MyripQ8K3I4 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MyripQ8K3I4 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MyripQ8K3I4 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MyripQ8K3I4 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
MyripQ8K3I4 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MyripQ8K3I4 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MyripQ8K3I4 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MyripQ8K3I4 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MyripQ8K3I4 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MyripQ8K3I4 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MyripQ8K3I4 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MyripQ8K3I4 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MyripQ8K3I4 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
MyripQ8K3I4 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MyripQ8K3I4 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MyripQ8K3I4 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MyripQ8K3I4 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MyripQ8K3I4 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MyripQ8K3I4 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MyripQ8K3I4 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MyripQ8K3I4 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
MyripQ8K3I4 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MyripQ8K3I4 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MyripQ8K3I4 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MyripQ8K3I4 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MyripQ8K3I4 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MyripQ8K3I4 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MyripQ8K3I4 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MyripQ8K3I4 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MyripQ8K3I4 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MyripQ8K3I4 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
MyripQ8K3I4 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MyripQ8K3I4 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MyripQ8K3I4 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MyripQ8K3I4 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MyripQ8K3I4 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MyripQ8K3I4 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MyripQ8K3I4 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MyripQ8K3I4 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MyripQ8K3I4 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MyripQ8K3I4 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MyripQ8K3I4 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MyripQ8K3I4 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MyripQ8K3I4 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms