Protein–RNA interactions for Protein: Q8K389

Cdk5rap2, CDK5 regulatory subunit-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5rap2Q8K389 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Cdk5rap2Q8K389 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Cdk5rap2Q8K389 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Cdk5rap2Q8K389 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Cdk5rap2Q8K389 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Cdk5rap2Q8K389 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Cdk5rap2Q8K389 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Cdk5rap2Q8K389 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Cdk5rap2Q8K389 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Cdk5rap2Q8K389 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Cdk5rap2Q8K389 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Cdk5rap2Q8K389 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Cdk5rap2Q8K389 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Cdk5rap2Q8K389 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Cdk5rap2Q8K389 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Cdk5rap2Q8K389 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Cdk5rap2Q8K389 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Cdk5rap2Q8K389 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Cdk5rap2Q8K389 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Cdk5rap2Q8K389 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Cdk5rap2Q8K389 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
Cdk5rap2Q8K389 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Cdk5rap2Q8K389 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Cdk5rap2Q8K389 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Cdk5rap2Q8K389 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Cdk5rap2Q8K389 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Cdk5rap2Q8K389 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Cdk5rap2Q8K389 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Cdk5rap2Q8K389 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Cdk5rap2Q8K389 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Cdk5rap2Q8K389 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Cdk5rap2Q8K389 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
Cdk5rap2Q8K389 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Cdk5rap2Q8K389 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Cdk5rap2Q8K389 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Cdk5rap2Q8K389 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Cdk5rap2Q8K389 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Cdk5rap2Q8K389 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Cdk5rap2Q8K389 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Cdk5rap2Q8K389 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
Cdk5rap2Q8K389 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Cdk5rap2Q8K389 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Cdk5rap2Q8K389 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Cdk5rap2Q8K389 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Cdk5rap2Q8K389 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Cdk5rap2Q8K389 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Cdk5rap2Q8K389 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Cdk5rap2Q8K389 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Cdk5rap2Q8K389 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Cdk5rap2Q8K389 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Cdk5rap2Q8K389 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Cdk5rap2Q8K389 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Cdk5rap2Q8K389 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Cdk5rap2Q8K389 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Cdk5rap2Q8K389 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Cdk5rap2Q8K389 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Cdk5rap2Q8K389 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Cdk5rap2Q8K389 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Cdk5rap2Q8K389 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
Cdk5rap2Q8K389 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Cdk5rap2Q8K389 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Cdk5rap2Q8K389 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Cdk5rap2Q8K389 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Cdk5rap2Q8K389 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Cdk5rap2Q8K389 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Cdk5rap2Q8K389 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Cdk5rap2Q8K389 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Cdk5rap2Q8K389 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Cdk5rap2Q8K389 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Cdk5rap2Q8K389 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Cdk5rap2Q8K389 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Cdk5rap2Q8K389 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Cdk5rap2Q8K389 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Cdk5rap2Q8K389 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Cdk5rap2Q8K389 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Cdk5rap2Q8K389 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Cdk5rap2Q8K389 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Cdk5rap2Q8K389 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Cdk5rap2Q8K389 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Cdk5rap2Q8K389 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Cdk5rap2Q8K389 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Cdk5rap2Q8K389 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Cdk5rap2Q8K389 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Cdk5rap2Q8K389 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Cdk5rap2Q8K389 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Cdk5rap2Q8K389 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Cdk5rap2Q8K389 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Cdk5rap2Q8K389 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Cdk5rap2Q8K389 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Cdk5rap2Q8K389 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Cdk5rap2Q8K389 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Cdk5rap2Q8K389 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Cdk5rap2Q8K389 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Cdk5rap2Q8K389 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Cdk5rap2Q8K389 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Cdk5rap2Q8K389 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Cdk5rap2Q8K389 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Cdk5rap2Q8K389 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Cdk5rap2Q8K389 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Cdk5rap2Q8K389 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms