Protein–RNA interactions for Protein: Q8K297

Colgalt1, Procollagen galactosyltransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colgalt1Q8K297 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Colgalt1Q8K297 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Colgalt1Q8K297 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Colgalt1Q8K297 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Colgalt1Q8K297 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Colgalt1Q8K297 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Colgalt1Q8K297 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Colgalt1Q8K297 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Colgalt1Q8K297 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Colgalt1Q8K297 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Colgalt1Q8K297 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Colgalt1Q8K297 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Colgalt1Q8K297 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Colgalt1Q8K297 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Colgalt1Q8K297 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Colgalt1Q8K297 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Colgalt1Q8K297 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Colgalt1Q8K297 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Colgalt1Q8K297 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Colgalt1Q8K297 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Colgalt1Q8K297 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Colgalt1Q8K297 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Colgalt1Q8K297 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Colgalt1Q8K297 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Colgalt1Q8K297 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Colgalt1Q8K297 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Colgalt1Q8K297 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Colgalt1Q8K297 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Colgalt1Q8K297 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Colgalt1Q8K297 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Colgalt1Q8K297 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Colgalt1Q8K297 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Colgalt1Q8K297 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Colgalt1Q8K297 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Colgalt1Q8K297 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Colgalt1Q8K297 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Colgalt1Q8K297 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Colgalt1Q8K297 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Colgalt1Q8K297 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Colgalt1Q8K297 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Colgalt1Q8K297 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Colgalt1Q8K297 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Colgalt1Q8K297 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Colgalt1Q8K297 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Colgalt1Q8K297 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Colgalt1Q8K297 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Colgalt1Q8K297 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Colgalt1Q8K297 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Colgalt1Q8K297 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Colgalt1Q8K297 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Colgalt1Q8K297 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Colgalt1Q8K297 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Colgalt1Q8K297 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Colgalt1Q8K297 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Colgalt1Q8K297 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Colgalt1Q8K297 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Colgalt1Q8K297 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Colgalt1Q8K297 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Colgalt1Q8K297 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Colgalt1Q8K297 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Colgalt1Q8K297 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Colgalt1Q8K297 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Colgalt1Q8K297 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Colgalt1Q8K297 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Colgalt1Q8K297 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Colgalt1Q8K297 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Colgalt1Q8K297 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Colgalt1Q8K297 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Colgalt1Q8K297 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Colgalt1Q8K297 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Colgalt1Q8K297 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Colgalt1Q8K297 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Colgalt1Q8K297 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Colgalt1Q8K297 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Colgalt1Q8K297 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Colgalt1Q8K297 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Colgalt1Q8K297 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Colgalt1Q8K297 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Colgalt1Q8K297 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Colgalt1Q8K297 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Colgalt1Q8K297 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Colgalt1Q8K297 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Colgalt1Q8K297 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Colgalt1Q8K297 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Colgalt1Q8K297 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Colgalt1Q8K297 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Colgalt1Q8K297 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Colgalt1Q8K297 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Colgalt1Q8K297 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Colgalt1Q8K297 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Colgalt1Q8K297 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Colgalt1Q8K297 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Colgalt1Q8K297 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Colgalt1Q8K297 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Colgalt1Q8K297 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Colgalt1Q8K297 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Colgalt1Q8K297 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Colgalt1Q8K297 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Colgalt1Q8K297 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Colgalt1Q8K297 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms