Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0D0

Cdk17, Cyclin-dependent kinase 17, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk17Q8K0D0 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdk17Q8K0D0 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdk17Q8K0D0 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdk17Q8K0D0 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdk17Q8K0D0 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdk17Q8K0D0 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdk17Q8K0D0 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdk17Q8K0D0 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdk17Q8K0D0 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdk17Q8K0D0 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdk17Q8K0D0 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdk17Q8K0D0 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdk17Q8K0D0 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdk17Q8K0D0 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdk17Q8K0D0 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdk17Q8K0D0 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdk17Q8K0D0 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdk17Q8K0D0 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdk17Q8K0D0 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdk17Q8K0D0 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdk17Q8K0D0 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdk17Q8K0D0 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdk17Q8K0D0 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdk17Q8K0D0 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdk17Q8K0D0 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdk17Q8K0D0 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdk17Q8K0D0 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdk17Q8K0D0 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdk17Q8K0D0 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdk17Q8K0D0 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdk17Q8K0D0 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdk17Q8K0D0 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdk17Q8K0D0 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdk17Q8K0D0 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdk17Q8K0D0 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdk17Q8K0D0 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdk17Q8K0D0 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdk17Q8K0D0 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdk17Q8K0D0 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdk17Q8K0D0 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdk17Q8K0D0 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdk17Q8K0D0 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdk17Q8K0D0 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdk17Q8K0D0 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdk17Q8K0D0 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdk17Q8K0D0 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdk17Q8K0D0 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdk17Q8K0D0 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdk17Q8K0D0 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Cdk17Q8K0D0 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cdk17Q8K0D0 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cdk17Q8K0D0 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cdk17Q8K0D0 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cdk17Q8K0D0 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cdk17Q8K0D0 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cdk17Q8K0D0 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cdk17Q8K0D0 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cdk17Q8K0D0 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cdk17Q8K0D0 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cdk17Q8K0D0 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdk17Q8K0D0 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdk17Q8K0D0 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdk17Q8K0D0 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdk17Q8K0D0 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdk17Q8K0D0 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdk17Q8K0D0 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdk17Q8K0D0 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdk17Q8K0D0 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdk17Q8K0D0 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdk17Q8K0D0 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdk17Q8K0D0 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdk17Q8K0D0 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdk17Q8K0D0 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdk17Q8K0D0 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdk17Q8K0D0 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdk17Q8K0D0 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdk17Q8K0D0 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdk17Q8K0D0 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdk17Q8K0D0 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdk17Q8K0D0 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdk17Q8K0D0 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdk17Q8K0D0 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdk17Q8K0D0 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdk17Q8K0D0 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdk17Q8K0D0 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdk17Q8K0D0 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdk17Q8K0D0 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdk17Q8K0D0 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdk17Q8K0D0 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdk17Q8K0D0 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cdk17Q8K0D0 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cdk17Q8K0D0 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cdk17Q8K0D0 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cdk17Q8K0D0 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cdk17Q8K0D0 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cdk17Q8K0D0 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cdk17Q8K0D0 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cdk17Q8K0D0 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cdk17Q8K0D0 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cdk17Q8K0D0 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms