Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHX7

Rftn2, Raftlin-2, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rftn2Q8CHX7 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rftn2Q8CHX7 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rftn2Q8CHX7 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rftn2Q8CHX7 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rftn2Q8CHX7 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rftn2Q8CHX7 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rftn2Q8CHX7 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rftn2Q8CHX7 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rftn2Q8CHX7 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rftn2Q8CHX7 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rftn2Q8CHX7 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rftn2Q8CHX7 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Rftn2Q8CHX7 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rftn2Q8CHX7 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rftn2Q8CHX7 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rftn2Q8CHX7 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Rftn2Q8CHX7 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rftn2Q8CHX7 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rftn2Q8CHX7 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rftn2Q8CHX7 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rftn2Q8CHX7 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rftn2Q8CHX7 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rftn2Q8CHX7 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rftn2Q8CHX7 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rftn2Q8CHX7 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rftn2Q8CHX7 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rftn2Q8CHX7 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rftn2Q8CHX7 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rftn2Q8CHX7 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Rftn2Q8CHX7 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rftn2Q8CHX7 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Rftn2Q8CHX7 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rftn2Q8CHX7 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rftn2Q8CHX7 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rftn2Q8CHX7 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Rftn2Q8CHX7 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rftn2Q8CHX7 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rftn2Q8CHX7 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rftn2Q8CHX7 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rftn2Q8CHX7 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Rftn2Q8CHX7 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rftn2Q8CHX7 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rftn2Q8CHX7 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rftn2Q8CHX7 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rftn2Q8CHX7 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rftn2Q8CHX7 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rftn2Q8CHX7 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rftn2Q8CHX7 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rftn2Q8CHX7 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rftn2Q8CHX7 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rftn2Q8CHX7 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rftn2Q8CHX7 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rftn2Q8CHX7 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rftn2Q8CHX7 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Rftn2Q8CHX7 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rftn2Q8CHX7 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rftn2Q8CHX7 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rftn2Q8CHX7 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rftn2Q8CHX7 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rftn2Q8CHX7 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rftn2Q8CHX7 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rftn2Q8CHX7 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rftn2Q8CHX7 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Rftn2Q8CHX7 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rftn2Q8CHX7 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rftn2Q8CHX7 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rftn2Q8CHX7 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rftn2Q8CHX7 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rftn2Q8CHX7 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rftn2Q8CHX7 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rftn2Q8CHX7 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rftn2Q8CHX7 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rftn2Q8CHX7 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rftn2Q8CHX7 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rftn2Q8CHX7 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rftn2Q8CHX7 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rftn2Q8CHX7 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rftn2Q8CHX7 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rftn2Q8CHX7 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Rftn2Q8CHX7 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rftn2Q8CHX7 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rftn2Q8CHX7 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rftn2Q8CHX7 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rftn2Q8CHX7 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rftn2Q8CHX7 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rftn2Q8CHX7 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rftn2Q8CHX7 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rftn2Q8CHX7 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rftn2Q8CHX7 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rftn2Q8CHX7 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rftn2Q8CHX7 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rftn2Q8CHX7 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rftn2Q8CHX7 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Rftn2Q8CHX7 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rftn2Q8CHX7 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rftn2Q8CHX7 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rftn2Q8CHX7 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rftn2Q8CHX7 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rftn2Q8CHX7 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rftn2Q8CHX7 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms