Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFA7

Klf17, Krueppel-like factor 17, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf17Q8CFA7 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Klf17Q8CFA7 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Klf17Q8CFA7 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Klf17Q8CFA7 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Klf17Q8CFA7 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Klf17Q8CFA7 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Klf17Q8CFA7 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Klf17Q8CFA7 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Klf17Q8CFA7 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Klf17Q8CFA7 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Klf17Q8CFA7 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Klf17Q8CFA7 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Klf17Q8CFA7 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Klf17Q8CFA7 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Klf17Q8CFA7 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Klf17Q8CFA7 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Klf17Q8CFA7 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Klf17Q8CFA7 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Klf17Q8CFA7 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Klf17Q8CFA7 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Klf17Q8CFA7 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Klf17Q8CFA7 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Klf17Q8CFA7 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Klf17Q8CFA7 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Klf17Q8CFA7 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Klf17Q8CFA7 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Klf17Q8CFA7 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Klf17Q8CFA7 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Klf17Q8CFA7 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Klf17Q8CFA7 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Klf17Q8CFA7 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Klf17Q8CFA7 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Klf17Q8CFA7 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Klf17Q8CFA7 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Klf17Q8CFA7 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Klf17Q8CFA7 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Klf17Q8CFA7 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Klf17Q8CFA7 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Klf17Q8CFA7 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Klf17Q8CFA7 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Klf17Q8CFA7 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Klf17Q8CFA7 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Klf17Q8CFA7 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Klf17Q8CFA7 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Klf17Q8CFA7 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Klf17Q8CFA7 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Klf17Q8CFA7 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Klf17Q8CFA7 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Klf17Q8CFA7 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Klf17Q8CFA7 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Klf17Q8CFA7 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Klf17Q8CFA7 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Klf17Q8CFA7 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Klf17Q8CFA7 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Klf17Q8CFA7 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Klf17Q8CFA7 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Klf17Q8CFA7 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Klf17Q8CFA7 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Klf17Q8CFA7 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Klf17Q8CFA7 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Klf17Q8CFA7 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Klf17Q8CFA7 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Klf17Q8CFA7 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Klf17Q8CFA7 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Klf17Q8CFA7 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Klf17Q8CFA7 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Klf17Q8CFA7 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Klf17Q8CFA7 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Klf17Q8CFA7 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Klf17Q8CFA7 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Klf17Q8CFA7 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Klf17Q8CFA7 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Klf17Q8CFA7 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Klf17Q8CFA7 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Klf17Q8CFA7 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Klf17Q8CFA7 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Klf17Q8CFA7 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Klf17Q8CFA7 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Klf17Q8CFA7 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Klf17Q8CFA7 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Klf17Q8CFA7 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Klf17Q8CFA7 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Klf17Q8CFA7 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Klf17Q8CFA7 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Klf17Q8CFA7 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Klf17Q8CFA7 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Klf17Q8CFA7 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Klf17Q8CFA7 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Klf17Q8CFA7 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Klf17Q8CFA7 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Klf17Q8CFA7 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Klf17Q8CFA7 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Klf17Q8CFA7 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Klf17Q8CFA7 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Klf17Q8CFA7 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Klf17Q8CFA7 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Klf17Q8CFA7 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Klf17Q8CFA7 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Klf17Q8CFA7 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Klf17Q8CFA7 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms