Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cdkl1Q8CEQ0 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cdkl1Q8CEQ0 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cdkl1Q8CEQ0 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cdkl1Q8CEQ0 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Cdkl1Q8CEQ0 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Cdkl1Q8CEQ0 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Cdkl1Q8CEQ0 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Cdkl1Q8CEQ0 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Cdkl1Q8CEQ0 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cdkl1Q8CEQ0 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cdkl1Q8CEQ0 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cdkl1Q8CEQ0 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cdkl1Q8CEQ0 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Cdkl1Q8CEQ0 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cdkl1Q8CEQ0 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cdkl1Q8CEQ0 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cdkl1Q8CEQ0 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms