Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDV6

Ccdc63, Coiled-coil domain-containing protein 63, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc63Q8CDV6 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc63Q8CDV6 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc63Q8CDV6 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc63Q8CDV6 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc63Q8CDV6 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc63Q8CDV6 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc63Q8CDV6 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc63Q8CDV6 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc63Q8CDV6 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc63Q8CDV6 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc63Q8CDV6 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc63Q8CDV6 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc63Q8CDV6 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc63Q8CDV6 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc63Q8CDV6 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc63Q8CDV6 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc63Q8CDV6 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc63Q8CDV6 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc63Q8CDV6 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc63Q8CDV6 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc63Q8CDV6 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc63Q8CDV6 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc63Q8CDV6 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc63Q8CDV6 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc63Q8CDV6 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc63Q8CDV6 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc63Q8CDV6 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc63Q8CDV6 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc63Q8CDV6 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc63Q8CDV6 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc63Q8CDV6 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc63Q8CDV6 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc63Q8CDV6 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Ccdc63Q8CDV6 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc63Q8CDV6 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc63Q8CDV6 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc63Q8CDV6 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc63Q8CDV6 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc63Q8CDV6 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc63Q8CDV6 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc63Q8CDV6 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc63Q8CDV6 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc63Q8CDV6 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc63Q8CDV6 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc63Q8CDV6 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc63Q8CDV6 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc63Q8CDV6 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc63Q8CDV6 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc63Q8CDV6 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc63Q8CDV6 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc63Q8CDV6 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc63Q8CDV6 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc63Q8CDV6 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc63Q8CDV6 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc63Q8CDV6 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc63Q8CDV6 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc63Q8CDV6 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc63Q8CDV6 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc63Q8CDV6 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc63Q8CDV6 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc63Q8CDV6 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc63Q8CDV6 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc63Q8CDV6 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc63Q8CDV6 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc63Q8CDV6 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc63Q8CDV6 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc63Q8CDV6 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc63Q8CDV6 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc63Q8CDV6 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc63Q8CDV6 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc63Q8CDV6 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc63Q8CDV6 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc63Q8CDV6 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc63Q8CDV6 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc63Q8CDV6 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc63Q8CDV6 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc63Q8CDV6 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc63Q8CDV6 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc63Q8CDV6 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc63Q8CDV6 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc63Q8CDV6 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc63Q8CDV6 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc63Q8CDV6 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc63Q8CDV6 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc63Q8CDV6 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc63Q8CDV6 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc63Q8CDV6 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc63Q8CDV6 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc63Q8CDV6 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc63Q8CDV6 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc63Q8CDV6 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc63Q8CDV6 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc63Q8CDV6 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc63Q8CDV6 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc63Q8CDV6 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc63Q8CDV6 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc63Q8CDV6 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc63Q8CDV6 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc63Q8CDV6 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc63Q8CDV6 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms