Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDM1

Atad2, ATPase family AAA domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atad2Q8CDM1 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atad2Q8CDM1 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atad2Q8CDM1 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atad2Q8CDM1 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atad2Q8CDM1 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atad2Q8CDM1 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Atad2Q8CDM1 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Atad2Q8CDM1 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Atad2Q8CDM1 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Atad2Q8CDM1 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Atad2Q8CDM1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Atad2Q8CDM1 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Atad2Q8CDM1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Atad2Q8CDM1 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Atad2Q8CDM1 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Atad2Q8CDM1 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Atad2Q8CDM1 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Atad2Q8CDM1 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Atad2Q8CDM1 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Atad2Q8CDM1 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Atad2Q8CDM1 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Atad2Q8CDM1 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Atad2Q8CDM1 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Atad2Q8CDM1 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Atad2Q8CDM1 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Atad2Q8CDM1 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Atad2Q8CDM1 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Atad2Q8CDM1 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Atad2Q8CDM1 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Atad2Q8CDM1 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Atad2Q8CDM1 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Atad2Q8CDM1 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Atad2Q8CDM1 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Atad2Q8CDM1 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Atad2Q8CDM1 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Atad2Q8CDM1 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Atad2Q8CDM1 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Atad2Q8CDM1 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Atad2Q8CDM1 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Atad2Q8CDM1 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Atad2Q8CDM1 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Atad2Q8CDM1 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Atad2Q8CDM1 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Atad2Q8CDM1 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Atad2Q8CDM1 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Atad2Q8CDM1 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
Atad2Q8CDM1 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Atad2Q8CDM1 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Atad2Q8CDM1 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Atad2Q8CDM1 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Atad2Q8CDM1 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Atad2Q8CDM1 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Atad2Q8CDM1 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Atad2Q8CDM1 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Atad2Q8CDM1 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Atad2Q8CDM1 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Atad2Q8CDM1 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Atad2Q8CDM1 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Atad2Q8CDM1 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Atad2Q8CDM1 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Atad2Q8CDM1 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Atad2Q8CDM1 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Atad2Q8CDM1 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Atad2Q8CDM1 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Atad2Q8CDM1 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Atad2Q8CDM1 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Atad2Q8CDM1 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Atad2Q8CDM1 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Atad2Q8CDM1 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Atad2Q8CDM1 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Atad2Q8CDM1 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Atad2Q8CDM1 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Atad2Q8CDM1 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Atad2Q8CDM1 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Atad2Q8CDM1 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Atad2Q8CDM1 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Atad2Q8CDM1 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Atad2Q8CDM1 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atad2Q8CDM1 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atad2Q8CDM1 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atad2Q8CDM1 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atad2Q8CDM1 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atad2Q8CDM1 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Atad2Q8CDM1 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Atad2Q8CDM1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Atad2Q8CDM1 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Atad2Q8CDM1 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Atad2Q8CDM1 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Atad2Q8CDM1 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Atad2Q8CDM1 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atad2Q8CDM1 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atad2Q8CDM1 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atad2Q8CDM1 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atad2Q8CDM1 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atad2Q8CDM1 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atad2Q8CDM1 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atad2Q8CDM1 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atad2Q8CDM1 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atad2Q8CDM1 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atad2Q8CDM1 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 145.8 ms